Bacillus spp. Suşlarından Ksilanaz Enziminin Kısmi Saflaştırılması ve Karakterizasyonu
Öz
β-1,4 bağlı ksilopiranozil rezidülerinden oluşan ksilanın β-1,4 glikozidik bağlarını yıkan ksilanaz, başta kağıt ve kağıt hamuru endüstrileri olmak üzere tekstil, yem, fırın ve biyoyakıt endüstrilerinde de geniş potansiyel uygulamalara sahip endüstriyel bir enzimdir. Bu çalışmada, Kilis 7 Aralık Üniversitesi merkez kampüs toprak örneğinden ksilanaz üretici Bacillus spp suşlarının izolasyonu ve saflaştırılan ksilanazın çeşitli endüstrilerdeki uygulanabilirliği araştırılmıştır. Ksilan içeren sıvı fermantasyon ortamında geliştirilen Bacillus spp suşundan hücre serbest elde edilen ham ksilanaz preparatına amonyum sülfat ve alkol çöktürme uygulanarak saflaştırılmıştır. En yüksek total ve spesifik enzim aktivitesi 723 U/L ve 64.81 U/mg olarak ham enzim preparatında saptanmıştır. Ksilanazın optimum aktivitesi 90°C ve pH 10.6’da belirlenmiştir. Enzimin 90°C sıcaklıkta 15 dakika ön inkübasyonu sonrası aktivitenin %167’e kadar arttığı saptanmıştır. Karakterizasyon çalışmalarındaki en yüksek aktivitesi 2935 U/L olarak hesaplanmıştır. SDS-PAGE ve zimogram analizlerinde, kısmi saflaştırılmış ekstraselüler ksilanaza ait ortalama 38.75 kDa moleküler ağırlığında tek protein bandı gözlenmiştir. Ksilanın ksilanaz enzimi ile hidrolizi sonucunda parçalama ürünleri olarak ksiloz ve ksilo-oligosakkaritler belirlenmiştir.
Anahtar Kelimeler
Bacillus spp.,karakterizasyon,kısmi saflaştırma,ksilan,ksilanaz
Teşekkür
Kaynakça
- Referans1 Abo-State, M. A. M., Fadel, M., Abdellah, E. M., and Ghaly, M. F., (2013). Studying the stability of cellulases and xylanase produced by thermophilic and alkaliphilic bacterial strains ısolated from agricultural wastes. American-Eurasian Jouranl of Agriculture and Environmental Sciences, 13(11), 1568-1575.
- Referans2 Aygan, A. (2008). Haloalkalofil Bacillus spp. izolasyonu, amilaz, selülaz ve ksilanaz enzimlerinin üretimi, karakterizasyonu ve biyoteknolojik uygulamalarda kullanılabilirliği. Doktora Tezi, Çukurova Üniversitesi, Fen Bililmleri Enstitüsü, Adana.
- Referans3 Butt, M. S., Nadeem, M. T., Ahmad, Z., and Sultan, M. T. (2008). Xylanases and their applications in baking ındustry. National Institute of Food Science and Technology, 46(1) 22–31.
- Referans4 Chakdar, H., Kumar, M., Pandiyan, K., Singh, A., Nanjappan, K., Kashyap1, P. L., and Srivastava, A.K, (2016). Bacterial xylanases: biology to biotechnology. 3 Biotech, 6(2), 150.
- Referans5 Chaturvedi, S., and Spaul Khurana, S. M. (2016). Partial purification and characterization of cellulase-free xylanase productıon from Bacillus licheniformis. International Journal of Pharma and Bio Sciences, 7(4), 144-149.
- Referans6 Cordeiro, C. A. M., Martins, M. L. L., Luciano, A. B., and Silva, R. F. (2002). Production and properties of xylanase from thermophilic Bacillus spp. Brazilian Archives of Biology and Technology an İnternational Journal, 45(4), 413-418.
- Referans7 Duarte, M. C. T., Pellegrino, A. C. A., Portugal, E. P, Ponezi, A. N., and Franco, T. T. (2000). Characterization of alkaline xylanases from Bacillus pumilus. M.C.T. Brazilian Journal of Microbiology, 31, 90-94.
- Referans8 Hiremath, K. S., and Patil, C. S. (2011). Isolation, production and characterization of alkalo thermostable xylanase from newly isolated Bacillus spp. International Journal of Biotechnology Applications, 3(1), 48-51.
- Referans9 Irfan, M., Asghar, U., Nadeem, M., Nelofer, R., and Syed, Q. (2016). Optimization of process parameters for xylanase production by Bacillus spp. in submerged fermentation. Journal of Radiation Research and Applied Sciences, 9, 139-147.
- Referans10 İnce, E. (2006). Ksilanaz üreten ekstrem termofil anaerobik bakterilerin izolasyonları ve enzimlerinin özelliklerinin belirlenmesi. Yüksek Lisans Tezi, Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Ankara.