Çoklu Antibiyotik Dirençli Gram Negatif Bakterilerde Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesi

Öz

Abstract Detection of Colistin Susceptibility in Multidrug Resistant Gram Negative Bacteria Aim: In this study, the detection of colistin sensitivity in multi antibiotic resistant strains of 121 Acinetobacter baumannii and 43 Pseudomonas aeruginosa isolates were investigated from clinical specimens, which was taken from inpatients of Mersin University, Faculty of Medicine, Health Research and Applications Services and sent to microbiology laboratory for routine diagnosis between December 2008 and August 2010. Materials and Methods: Conventional bacteriological methods and fully automated detection system (Vitek-2, BioMerieux, Fransa) were used to identify the isolates. The colistin sensitivity of the isolates was detected by Kirby Bauer disc diffusion and E-test methods according to the standards described by The Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Genotypic similarities between multiple antibiotic-resistant 164 clinical isolates and 5 environmental isolates were detected with “Arbitrarily Primed Polymerase Chain Reaction” (AP-PCR). Results: All of the A. baumannii isolates, [121 (100%)] were sensitive to colistin by E-test, 113 (93.4 %) were sensitive and, 8 (6.6 %) were intermediate sensitive to colistin by disk diffusion method. Four (100%) of the 43 P. aeruginosa isolates were sensitive to colistin by disk diffusion method, 2 (4.7%) were intermediate sensitive and 41 (95.3%) were sensitive to colistin by E-test method. According to the Gel Compar software evaluation of AP-PCR results of multiple antibiotics resistant A. baumannii strains those are isolated from inpatients; genetic proximity is found to be about 80% and it is anticipated that this can be cause of nosocomial infections. Conclusion: A very high rate of antimicrobial resistance of the isolated original strains is an indication that infections caused by those original strains became a serious problem at our hospital. High in-vitro sensitivity of original strains included in this study at the existence of such antimicrobial resistant period is evaluated to be promising for treatment options.

Anahtar Kelimeler

• Acinetobacter baumannii; colistin; Pseudomonas aeruginosa

Çoklu Antibiyotik Dirençli Gram Negatif Bakterilerde Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesi

Öz

Türkçe Özet:Amaç: Bu çalışmada, Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Merkezi servislerinde yatan hastalardan, Aralık 2008-Ağustos 2010 tarihleri arasında Mikrobiyoloji laboratuvarına rutin tanı amacı ile gönderilen klinik örneklerden izole edilen, çoklu antibiyotik dirençli 121 Acinetobacter baumannii ve 43 Pseudomonas aeruginosa suşu kolistin duyarlılığı açısından incelenmiştir. Gereç-Yöntem: İzolatların tanımlanmasında konvansiyonel bakteriyolojik yöntemler ve tam otomatik tanımlama sistemi (Vitek 2, BioMerieux, Fransa) kullanılmıştır. Suşların kolistin duyarlılığı E-test yöntemiyle tespit edilmiştir. Çoklu antibiyotik dirençli 164 köken ile çevre örneklerinden izole edilen 5 kökenin genotipik benzerliklerini saptamak için “Arbitrarily Primed Polymerase Chain Reaction” (AP-PZR) yöntemi uygulanmıştır. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 121 A. baumannii kökeninin 121 (%100)\'i kolistine duyarlı, P. aeruginosa kökenlerinin ise 2\'si orta duyarlı (%4.7), 41\'i duyarlı (%95.3) olarak tespit edilmiştir. Yatan hastalardan izole edilen çoklu antibiyotik dirençli A. baumannii suşlarının AP-PZR sonuçlarının, Gel Compar yazılımı kullanılarak yapılan değerlendirme sonucunda, %80\'inin üzerinde genetik yakınlık bulunmuş ve hastane infeksiyon etkeni olabileceği düşünülmüştür. Sonuç: İzole edilen kökenlerde oldukça yüksek oranda antimikrobiyal direnç, hastanemizde bu kökenlerin neden olduğu infeksiyonların önemli bir sorun haline geldiğinin bir göstergesidir. Antimikrobiyallere direncin yüksek olduğu bu dönemde çalışmaya dahil edilen kökenlerin in vitro kolistin duyarlılığının yüksek olması tedavi seçeneğimiz açısından umut verici olarak değerlendirilmiştir.

Anahtar Kelimeler

• Acinetobacter baumannii; kolitsin; Pseudomonas aeruginosa

Kaynakça

1. Demirtürk N, Demirdal T. Antibiyotiklerde direnç sorunu. Kocatepe Tıp Derg 2004;5117—2].
2. Andrew W. Melanie D. Kim N. Mulvey MR. Hoban D. Zhanel G. Antimicrobial susceptibility of Pseudomonas aeruginosa isolates obtained from patient in Canadian intensive care units as part of the Canadian National intensive care unit study. Diagn Microbial Inşecr 2008;61:217-21.
3. Azap Ö. Arslan H, Ergin F, lnci E, Yapar G. In vitro activity of colistin against nonfennentaıive Gram negatif bacilli. Ankara Unit: Tip FMez-nııuısı 2005 ;58:65-7.
4. Lisa A. Laurie B. Isaac F. Jeremy S. John C. Colistin Methanesulfonate against multidrug—resistant Acinetobacter baumannii in an in vitro pharmacodynamic model. Antiınir'roh Agents C iıemorlıeı' 2007;51 :3431-3.
5. Akçam ZF. Gönen İ, Kaya 0. Yaylı G. Hastane infeksiyonu etkeni enterobakterilerde beta-laktam antibiyotiklere duyarlılık ve ESBL sıklığının araştırılması. Süleyman Demirel Ü Tıp F Derg 2004;l 1:6-9.
6. Çaylan R. Çok ilaca dirençli hastane kökenli Gram negatif bakteriler: Ülkemizdeki durum. tedavi ve kontrol politikaları. XI. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi. 30 Mart—3 Nisan 2003, İstanbul. Kongre Özet Kitabı,18—20.
7. Gülay Z. Gram negatif bakterilerdeki moleküler direnç mekanizmaları. In: Yiice A, Çakır N (Eds). Hastane infeksiyonları. 2. baskı. İzmir: Güven Kitabevi. 2009:149- 79.
8. Arman D. Yoğun bakımda Gram negatif bakteri sorunu. Ankenı Derg 2009;23: 148-56.

9. İnan D, Saba R, Gunseren F. et al. Daily antibiotic cost of nosocomial infections in a Turkish university hospital. BMC Infect Dis 2005:5:5.
10. Eser ÖK, Kocagöz S, Ergin A, Altun B, Hasçelik G. Yoğun baktın ünitelerinde infeksiyon etkeni olan Gram negatif basillerin değerlendirilmesi. İnfeksiyon Derg 2005;19:75—80.
11. Altunçekiç A. Arman D. Acinerobacrer cinsi bakterilerin mikrobiyolojisi. direnç mekanizmaları ve çoklu dirençli suşlaı'da tedavi. In: Arman D, Ünal S (Eds). Yeni ve yeniden gündeme gelen infeksiyonlar. Ankara: Bilimsel Tıp. 2009:123»36.
12. Erdem B. Pseudomonasl'ar. ln: Ustaçelebi Ş. Mutlu G. İmir T (Eds). Temel ve Klinik Mikrobiyoloji. 10.baskı. Ankara: Güneş Kitabevi. 1999:551-8.
13. Fidan [. Gürelik FÇ. Yüksel S. Sultan N. Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik direnci ve metalle-beta- laktanıaz sıklığı. Ankenı Derg 2005;19:68—70.
14. Akalın H. Kolistin. ANKEM 2007; 21: 26-8.
15. Clinical and Laboratory Standarts Institute. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twentieth lnformational Supplement. CLSI document MIOO-SZO. Wayne. PA: CLSI'. 2010.
16. Durmaz R, Ayan M. Acinetobacter baunıanni izolatlarının ınoleküler epidemiyolojisinde Arbitrarily Primed "PZR ve Pulsed-Field Gel“ Elektı'ofoı'ezi. In: Durmaz R (Ed.). Uyguianıaiı Molekiiier Mikrobivaioji. Nobel Tip Kitabevleri, İstanbul, 20011219—28. Öztürk ve (ırk.
17. l'i. Özdemir M. Erayman l. Gündem NS. Baykan M. Baysal B. Hastane infeksiyonu etkeni Aırincmixn'ıer suşlarının
18. çeşitli antibiyotiklere duyarlılıklarımn araştırılması. Ani—'em Derg 2009:231127—32.
19. Akın Ö.Bayram A,Balcı l.Çoğul dirençli (n.-inemimı'ter imnnmnnii izolatlarında kulitsin .polimiksin B ve tigesiklin direncinin saptanmasında disk difüzyon .E—test ve htıyyon mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırınıası. Mikrobiyol Bni. 20l0‘. 442203—104
20. Zer Y. Akın OFE Namıduru M. Arinetrıbcıcter innımımnii atışlarında tiger—;iklin etkinliğinin nraştırılmam. İnfekxiymı Derg 2007;21: 193-6.
21. Wang H. Guo P. Sun H. cl al. Molecular epidemiology of clinical isolates of earhapenem—ı'esistaııt Arinwabaı'ıer
22. spp. from Chinese hospitals. Antimiı'mb Agents- Cheınıniıer 20075 l :4022—8.
23. Arroyo LA. Curie AG. İbanez MEP. et al. Reliability ol' the E—Test Method for Detection of Cnlistin Resistaneein Clinical 1501;1le of Aı'inembrmfe'r baumannii. J Clin Miı'mbioi 2005;43:903—5.