Resistance Profile of Acinetobacter Baumannii Strains Isolated from Intensive Care Units: A Five-Years Study

Öz

Objective: In recent years antibiotic resistance has risen worldwide. It poses a serious health threat to intensive care unit (ICU) patients. Acinetobacter baumannii has become an important cause of multidrug resistant infections, especially patients in ICU. The aim of this study was to screen antibiotic resistance profiles in A.baumannii strains isolated from ICU. Methods: In this study, A.baumannii strains isolated from clinical samples sent from ICUs to microbiology laboratory between 2015-2019, were evaluated. Bacterial identification and antibiotic susceptibility tests were performed using conventional methods and automated systems. Results: A total of 773 A.baumannii isolates were included in the study. Among the samples in which strains were isolated, endotracheal aspirate samples was found first (65.3%). A.baumannii strains showed the highest resistance to carbapenems (96.5%). Ciprofloxacin 96.1%, netilmicin 89.8%, gentamicin 88%, amikacin 66% and trimethoprim-sulfamethoxazole 67.7% resistance were detected. Also, the resistance rates have increased over the years. Conclusion: As a result, the resistance rates of A.baumannii strains to antimicrobial agents differ between hospitals, each hospital should periodically review its own antibiotic resistance profile and determine their antibiotic use policies. The usage of broad-spectrum antibiotics should be restricted due to high resistance rates.

Anahtar Kelimeler

• Intensive Care Unit
• Acinetobacter Baumannii
• Antibiotic Resistance

Yoğun Bakım Ünitelerinden İzole Edilen Acinetobacter Baumannıı Suşlarının Direnç Profili: Beş Yıllık Çalışma

Öz

Amaç: Antibiyotik direnci son yıllarda tüm dünyada artış göstermiştir. Bu durum özellikle yoğun bakım ünitelerinde (YBÜ) yatan hastalarda ciddi sağlık problemi oluşturmaktadır. Acinetobacter baumannii YBÜ’de yatan hastalarda çoklu ilaç dirençli enfeksiyonların önemli bir nedeni haline gelmiştir. Bu çalışmanın amacı YBÜ’den izole edilen A.baumannii suşlarının direnç oranlarını saptamaktır. Gereç ve Yöntem:2015-2019 yılları arasında YBÜ’lerden mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen çeşitli örneklerden izole edilen A.baumannii suşları çalışmaya dahil edilmiştir. Bakteri tanımlaması ve antibiyotik duyarlılık testleri konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistemler kullanılarak yapılmıştır. Bulgular: Toplam 773 A.baumannii suşu çalışmaya dahil edilmiştir. Suşların izole edildiği örnekler arasında endotrakeal aspirat örnekleri ilk sırada (%65.3) saptanmıştır. İzole edilen A.baumannii suşlarının en dirençli olduğu antibiyotik grubu karbapenemler (%96.5) olarak bulunmuştur. Siprofloksasine %96.1, netilmisine %89.8, gentamisine %88, amikasine %66 ve trimetoprim-sülfametoksazole %67.7 direnç tespit edilmiştir. Ayrıca, direnç oranlarının yıllar içinde arttığı gözlenmiştir. Sonuç: A.baumannii suşlarının antimikrobiyal ajanlara direnç oranları hastaneler arasında farklılık gösterdiğinden her hastane belirli aralıklarla kendi antibiyotik direnç profilini gözden geçirmeli ve antibiyotik kullanım politikalarını belirlemelidir. Ayrıca geniş spektrumlu antibiyotiklerin yaygın kullanımının kısıtlanarak direnç gelişiminin önlenmesi hedeflenmelidir.

Anahtar Kelimeler

• Acinetobacter Baumannii
• Antibiyotik Direnci
• Yoğun Bakım Ünitesi

Kaynakça

1. Liu Q, Li W, Du X, Li W , Zhong T , Tang Y, Feng Y , et al. Risk and prognostic factors for multidrugresistant Acinetobacter baumannii complex bacteremia: a retrospective study in a Tertiary Hospital of West China. PLoS ONE 2015;10(6):1-13. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0130701
2. Çerçioğlu D, Cesur S, Hatipoğlu ÇA, Yıldırım M, Çelik H, Kınıklı S, ve ark. İntratekal kolistinle başarıyla tedavi edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii’ye bağlı nozokomiyal menenjit. Klimik Derg 2017;30(3):155-7. https://doi.org/10.5152/kd.2017.38
3. Gazel D, Ekşi F, Azzawi S, Güneş İ, Turan E. Acinetobacter baumannii izolatlarında kolistin heterodirencinin araştırılması. ANKEM Derg 2019;33(3):114-120. https://doi.org/10.5222/ankem.2019.114
4. Uwingabiye J, Lemnouer A, Roca I, Alouane T, Frikh M, Belefquih B, et al. Clonal diversity and detection of carbapenem resistance encoding genes among multidrug-resistant Acinetobacter baumannii isolates recovered from patients and environment in two intensive care units in a Moroccan hospital. Antimicrob Resist Infect Control 2017;6(99):1-9. https://doi.org/10.1186/s13756-017-0262-4
5. Doruk S, Köseoğlu Hİ, Yenişehirli G, Etikan İ, Sağlam DA, Yılmaz A, ve ark. Multidrug resistance among A.baumannii isolates from intensive care unit: a four years retrospective study. Turkiye Klinikleri Arch Lung 2016;17(2):15-20. https://doi.org/ 10.5336/archlung.2015-49146
6. Uğur M, Genç S. Yoğun bakım ünitelerinden izole edilen Acinetobacter baumannii ve Pseudomonas aeruginosa suşlarının üç yıllık direnç profili. J Turk Soc Intens Care 2019; 17:130-137. https://doi.org/10.4274/tybd.galenos.2018.94103
7. Tümtürk A, Tekçe AY, Şanal L. Nozokomiyal infeksiyon etkeni Gram negatif bakterilerde karbapenem direnç oranları: Üçüncü basamak bir hastaneden retrospektif bir çalışma. Ortadogu Tıp Derg 2019;11(4):422-426. https://doi.org//10.21601/ortadogutipdergisi.516673
8. Celiloğlu C, Tolunay O, Çelik T, Sucu A, Yurtçu E, Çelik Ü. Çocuk yoğun bakım ünitesindeki hastane enfeksiyonlarının değerlendirilmesi. J Pediatr Inf 2017;11(3):129-134. https://doi.org/10.5578/ced.64028

9. Coşkun US. Karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında antibiyotik direncinin araştırılması. ANKEM Derg 2018;32(2):37-44. https://doi.org/10.5222/ankem.2018.037
10. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters Version 9.0, http://www.eucast.org (erişim tarihi: 20.05.2020)
11. Şahin AR, Yıldız BT, Aktemur A, Topal B, Nazik S, Ateş S. Bir üniversite hastanesi noroloji yoğun bakım ünitesinde gelişen enfeksiyonların değerlendirilmesi. J Contemp Med 2019;9(1):43-47. https://doi.org/10.16899/gopctd.481366
12. Barış A, Bulut ME, Öncül A, Bayraktar B. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalara ait klinik izolatların tür dağılımı ve antibiyotik duyarlılıkları. J Turk Soc Intensive Care 2017;15(1):21-7. https://doi.org/10.4274/tybdd.55707
13. Şahin AR, Doğruer D, Nazik S, Aktemur A, Öksüz H, Aral M, ve ark. Hastane kökenli patojenlerde artan antimikrobiyal direnç sorunu: Acinetobacter baumannii. Online Türk Sağ Bil Derg 2019;4(2):156-169. https://doi.org/10.26453/otjhs.462304
14. Cesur S, Irmak H, Yalçın AN, Berktaş M, Baysan BÖ, Kınıklı S, ve ark. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların çeşitli kültür örneklerinden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Ortadoğu Tıp Derg. 2017;9(2):51-5. https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.291062
15. Kapoor K, Jain S, Jajoo M, Dublish S, Dabas V, Manchanda V. Risk factors and predictors of mortality in critically ill children with extensively drug resistant Acinetobacter baumannii infection in a pediatric intensive care unit. Iran J Pediatr 2014;24(5):569-574.
16. Eroğlu C, Ünal N, Karadağ A, Yılmaz H, Acuner İÇ, Günaydın M. Çeşitli klinik örneklerden 2006-2011 yılları arasında izole edilen Acinetobacter türleri ve antibiyotik duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg 2016;73(1):25-32. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2016.68915
17. Telli M, Eyigör M, Korkmazgil B, Aydın N, Atalay MA. Acinetobacter spp. klinik izolatlarında karbapenem direncinin moleküler epidemiyolojisi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2017;47(4):190-196. https://doi.org/10.5222/TMCD.2017.190
18. Demirci M, Yiğin A, Demir C. Karbapeneme dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında OXA tipi karbapenemaz genlerinin dağılımının gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle incelenmesi. Klimik Derg 2019;32(2):123-6. https://doi.org/10.5152/kd.2019.29
19. Spellberg B, Bonomo RA. Combination therapy for extreme drug resistant (XDR) Acinetobacter baumannii: ready for prime-time? Crit Care Med 2015;43(6):1332–1334. https://doi.org/10.1097/CCM.0000000000001029
20. Şafak B, Kılınç O, Tunç N. Klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılık oranlarının incelenmesi (2010-2016). FLORA 2016;21(2):77-81.
21. Sezer BE, Doğan M, Aldağ ME, Tülük G. Kolistin dirençli Acinetobacter baumannii tedavisinde sıra dışı bir antibiyotik kombinasyon tedavisi: trimetoprim-sülfametoksazol ve kolistin kombinasyonu. ANKEM Derg 2017;31(1):32-39. https://doi.org/10.5222/ankem.2017.032
22. Yıldız İ, Bayır H, Küçükbayrak A, Yoldaş H, Balcı M, Erkuran MK, ve ark. Acinetobacter infection and resistance profile of intensive care units in a city of Northwestern Anatolia. Acta Med Anatol 2016;4(3):98-100. https://doi.org/10.5505/actamedica.2016.52714
23. Alada DM, Altoparlak Ü, Coşkun MV. Çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının Acinetobacter suşları üzerine in vitro etkinliğinin araştırılması. ANKEM Derg 2017;31(1):23-31. https://doi.org/10.5222/ankem.2017.023
24. Şirin MC, Ağuş N, Yılmaz N, Bayram A, Hancı SY, Şamlıoğlu P, ve ark. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017;74(3):269-278. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2017.94899
25. Gözalan A, Ünaldı Ö, Kırca F, Çöplü N, Müderris T, Açıkgöz ZC, ve ark. Yoğun bakım ünitelerinde kan dolaşımı enfeksiyonu etkeni karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarının moleküler yöntemlerle karakterizasyonu. Turk Hij Den Biyol Derg, 2020;77(1):15-24. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2019.53323
26. Vural DG, Durupınar B. karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii klinik izolatlarında sınıf D beta laktamaz varlığının araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2016;46(4):181-187. https://doi.org/10.5222/TMCD.2016.181
27. Şahintürk H, Özdemirkan A, Kılıç F, Özalp O, Arslan H, Zeyneloğlu P, ve ark. Cerrahi yoğun bakım hastalarında çoklu ilaç dirençli enfeksiyonların mortalite üzerine etkisi. J Turk Soc Intensive Care 2018;16:58-63. https://doi.org/10.4274/tybd.73636
28. Çelik N, Çelik O, Aslan H, Savaş G, Yılmaz Sİ. Erzurum Bölge Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde tespit edilen Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik direnç oranları. Sakarya Tıp Derg 2017;7(4):229-234.
29. Dursun A, Özsoylu S, Kılıç H, Kılıç AU, Akyıldız BN. Çocuk yoğun bakım ünitesinde yatan hastalardan izole edilen Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae ve Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Turk J Intensive Care 2018;16:109-14. https://doi.org/10.4274/tybd.63825.