Samsun ilinde mısır (Zea mays L.) üretim alanlarında enfeksiyon oluşturan virüslerin belirlenmesi

Öz

Samsun ilinde 184 farklı mısır tarlasında 2009-2010 yıllarında sürvey çalışmaları gerçekleştirilmiştir. I. üretim alanlarından toplanan 290 yaprak örneğinin, Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) yöntemi ile test edilmesi sonucunda, %4.8’inin Maize dwarf mosaic virus (MDMV) ile enfekteli olduğu belirlenmiştir. Bu örneklerde Sugarcane mosaic virus (SCMV) ve Sorghum mosaic virus (SrMV)’e rastlanılmamıştır. Farklı bölge ve simptomları yansıtacak şekilde 290 örnek içerisinden seçilen 130 örneğin ELISA ile testi sonucunda ise, %7.7’sinin Maize mosaic virus (MMV) ve %3.1’inin Barley yellow dwarf virus (BYDV)-PAV ırkı ile enfekteli olduğu saptanmıştır. Ancak, testlenen 130 örnekte BYDV-MAV ırkına ve Maize stripe virus (MSpV)’e rastlanmamıştır. Silajlık olarak yetiştirilen II. üretim mısır alanlarında ise toplam 111 adet yaprak örneği ELISA yöntemi ile test edilmiş olup, bu örneklerin %55’inin MMV, %0.9’unun BYDV-PAV ve %0.9’unun MDMV ile enfekteli olduğu belirlenmiştir. Sadece 1 örnekte MDMV+MMV ikili virüs enfeksiyonu (%0.9) tespit edilmiştir. Bu mısır alanlarında SCMV, SrMV, MSpV ve BYDV-MAV ile enfekteli örnek tespit edilmemiştir. Ayrıca, bölgede MDMV’ün varlığı, reverse transkripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) yöntemi ile de teyit edilmiştir.

Anahtar Kelimeler

• BYDV-PAV,ELISA; MDMV; Mısır; MMV; RT-PCR

Determination of viruses causing infection in corn (Zea mays L.) fields in Samsun province

Öz

Survey studies were carried out in 184 corn fields in Samsun province in 2009-2010. A total of 290 leaf samples collected from the first-crop corn planted areas were tested by Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) method, and 4.8% of these samples were found to be infected with for Maize dwarf mosaic virus (MDMV). Sugarcane mosaic virus (SCMV) and Sorghum mosaic virus (SrMV) were not detected in these samples. A hundred-thirty samples out of 290 were selected according to different symptom appearance and various locations where surveys were performed. Result of serological tests showed that 7.7% and 3.1% of these samples were infected with MMV (Maize mosaic virus) and BYDV-PAV (Barley yellow dwarf virus), respectively. However, BYDV-MAV and Maize stripe virus (MSpV) were not determined in these samples. A total of 111 leaf samples collected from the second-crop corn planted for silage production were tested by ELISA, and 55%, 0.9% and 0.9% were found to be infected with MMV, BYDV-PAV and MDMV, respectively. In only one sample, double infections of MDMV and MMV were determined (0.9%). None of the samples collected from the second-crop corn fields in Samsun were infected with SCMV, SrMV, MSpV and BYDV-MAV. Additionally, MDMV infection was confirmed by using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) in the region.

Anahtar Kelimeler

• BYDV-PAV,ELISA; MDMV; maize; MMV; RT-PCR

Kaynakça

1. Achon, M.A., Serrano, L., Alonso-Duenas, N., Porta, C., 2008. Complete genome sequences of maize dwarf mosaic virus and sugarcane mosaic virus isolates coinfecting maize in Spain. Archives of Virology, 152: 2073–2078.
2. Baloğlu, S., Aktura, T., Yılmaz, M.A., 1991. Çukurova Bölgesinde yetiştirilen I. ve II. ürün mısırda mekanik olarak taşınabilen virüslerin saptanması. VI. Türkiye Fitopatoloji Kongresi Bildirileri, 7- 11 Ekim, İzmir, s: 329-332.
3. Bremer, K., Raatikainen, M., 1975. Cereal disease transmitted or caused by aphids and leafhoppers in Turkey. Annales Academiae Scientiarum Fennicae, IV. Biologica, 203: 1-14.
4. Clark, M.F., Adams, A.N., 1977. Characteristics of the microplate method of enzyme-linked ımmunosorbent assay for the detection of plant viruses. Journal of General Virology, 34: 475- 483.
5. D’Arcy, C.J., Itnyre, R.L., Nass, P.H., Cheng, S., 1995. Barley yellow dwarf at Illinois: Progress and prospects. Züchtungsfor schung- Berichte aus der Bundesanstalt für Züchtungsforschung an Kulturpflanzen, 1: 59-62.
6. Değirmenci, K., Akbaş, B., Cengiz, R., Ertunç, F., 2013. Bazı mısır hatlarına ait tohumlarda maize dwarf mosaic virus (MDMV)’nün varlığının belirlenmesi ve termoterapi uygulaması ile tohumdan arındırılması. Tarla Bitkileri Merkez Araştırma Enstitüsü Dergisi, 22 (2): 69-73.
7. Erkan, E., Kutluk Yılmaz, N.D., 2009. Samsun İli buğday Üretim Alanlarında Enfeksiyon Oluşturan Virüslerin Saptanması. Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi, 24(2): 67-75.
8. Fidan, H., Yılmaz, M.A., 2004. Çukurova Bölgesi mısır ekim alanlarında zararlı spiroplasma ve önemli virüs hastalık etmenlerinin saptanması. Türkiye I. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri, 8-10 Eylül 2004, Samsun, 210.

9. Ford, R.E., Tosic, M., Shukla, D.D., 2004. Maize dwarf mosaic virus. Descriptions of Plant Viruses Online, No: 341.
10. Geering, A., Thomas, J., Persley, D., 2004. A national diagnostic protocol for the identification of Maize dwarf mosaic virus. 19-28.
11. İlbağı, H., Çıtır, A., 2004. Türkiye’de tahıl virüs hastalıkları ve yayılış alanları. Türkiye I. Bitki Kongresi Kong. 8-10 Eylül, Samsun, 176.
12. İlbağı, H., Rabenstein, F., Habekuss, A., Ordon, F., Citir, A., 2006. Incidence of virus diseases in maize fields in the Trakya region of Turkey. Phytoprotection, 87 (3): 115-122.
13. İlbağı, H., Geyik, S., 2014. Türkiye’de Bursa İli mısır (Zea mays L.) tarlalarında görülen virüs hastalıklarının saptanması. Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi, 11 (1): 122-125.
14. Jiang, J.X., Zhou X.P., 2002. Maize dwarf mosaic disease in different regions of China is caused by Sugarcane mosaic virus. Archives of Virology, 147: 2437-2443.
15. Koike, H., Gillaspie, A.G., 1976. Strain M. A new strain of sugarcane mosaic virus. The Plant Diseases Reporter, 60: 50-54.
16. Mohammadi, M.R., Hajieghrari, B., 2009. Sugarcane mosaic virus: The causal agent of mosaic disease on sorghum (Sorghum bicolor L.) in Tehran province of Iran. African Journal of Biotechnology, 8(20): 5271-5274.
17. Mayo, M.A., D’Arcy, C.J., 1999. Family Luteoviridae: A reclassification of Luteoviruses, 15- 22.
18. Nault, L.R., Gordon, D.T., Gıngery, R.E., Bradfute, O.E., Castillo Loayza, J., 1979. Identification of maize viruses and mollicute and their potential insect vectors in Peru. Phytopathology, 69: 824-828.
19. Petrik, K., Sebestyen, E., Gell, G., Balazs, E., 2010. Natural insertions within the N terminal region of the coat protein of Maize dwarf mosaic potyvirus (MDMV) have an effect on the RNA stability. Virus Genes, 40: 135-139.
20. Shurtleff, M.C., 1980. Compendium of corn diseases. St. Paul, M.N. American Phytopathological Society, 60-63.
21. Sum, I., Sebestyen, E., Papp, I., Liszt, A., 1979. Növenytermeles. Crop Production, 28: 309-315.
22. Teakle, D.S., Grylls, N.E., 1973. Four strains of sugarcane mosaic virus infecting cereals and other grasses in Australia. Australian Journal of Agricultural Resesearch, 24: 465-477.
23. Tobias, I., Palkovics, L., 2004. An unusual feature at the N-terminal end of the coat protein of Maize dwarf mosaic virus isolated in Hungary. Journal of Phytopathology, 152: 445-447.
24. Tsai, J.H., 1975. Occurrence of a corn disease in Florida transmitted by Peregrinus maidis. The Plant Disease Reporter, 59: 830-833.
25. TÜİK, 2009. http://www.tuik.gov.tr (06.12.2010)
26. Wang, J.G., Zheng, H.Y., Chen, H.R., Adams, M.J., Chen, J.P., 2010. Molecular diversities of sugarcane mosaic virus and sorghum mosaic virus isolates from Yunnan province, China. Journal of Phytopathology, 158: 427-432.