Identification Methods of Pathogenic Streptomyces Species on Potato

Yıl 2014, Cilt: 1 Sayı: 2, 80 - 90, 25.12.2014

Aynur Karahan Yakup Zekai Katırcıoğlu

Öz

Since Streptomyces scabiei causing potato common scab disease was identified firstly in 1890 by Thaxter methods used for the diagnosis of Streptomyces species have evolved continuously. In the 1940s with the discovery of antibiotics produced by Streptomyces species, the number of Streptomyces species defined up to 40 has increased by upon 3000. However many of species identified in this period were synonyms. Morphological and physiological methods such as spore chain morphology, spore color, substrate mycelium and soluble pigments, melanin production and use of some carbon sources in use of identification of Streptomyces species including pathogenic species are put forward with this project. During this period, more than 200 Streptomyces species were re-defined and the type cultures of them were placed in international culture collections. Today, pathogenicity, fatty acid analysis and molecular methods such as PCR have been used for the identification of pathogenic Streptomyces species on potato such as S. scabiei, S. acidiscabies, S. turgidiscabies, S. europaeiscabiei, S. stelliscabiei, S. luridiscabiei, S. puniciscabiei and S. niveiscabiei as well as classic morphological and physiological methods.

Anahtar Kelimeler

Streptomyces, Potato, Plant Pathogen, Identification methods

Patateste Patojen Streptomyces Türlerinin Tanılama Yöntemleri

Öz

Patates adi uyuz hastalığına sebep olan Streptomyces scabiei’nin 1890 yılında ilk olarak Thaxter tarafından tanılanmasından bu yana Streptomyces türlerinin tanısı için kullanılan metotlar sürekli olarak gelişmiştir. 1940’lı yıllarda Streptomyces türleri tarafından üretilen antibiyotiklerin keşfi ile 40 kadar tanımı yapılmış Streptomyces türünün sayısı kısa sürede 3000’ in üzerine çıkmıştır. Ancak bu dönemde tanısı yapılan türlerin birçoğu sinonimdir. Günümüzde patojen türler de dâhil olmak üzere Streptomyces türlerinin tanısında kullanılmakta olan spor zinciri morfolojisi, spor rengi, substrat miselyum ve çözülebilir pigmentler, melanin üretimi ve bazı karbon kaynaklarını kullanma durumları gibi morfolojik ve fizyolojik metotlar bu proje ile ortaya konulmuştur. Bu dönemde 200’den fazla Streptomyces türü yeniden tanımlanmış ve tip kültürleri uluslararası kültür koleksiyonlarına yerleştirilmiştir. Günümüzde S. scabiei, S. acidiscabies, S. turgidiscabies, S. europaeiscabiei, S. stelliscabiei, S. luridiscabiei, S. puniciscabiei ve S. niveiscabiei gibi patateste patojen Streptomyces türlerinin tanısında klasik morfolojik ve fizyolojik metotların yanı sıra patojenisite, hücresel yağ asidi kompozisyonunun tespitine dayanan yağ asidi analizi ve PCR gibi moleküler metotlar da kullanılabilmektedir.

Anahtar Kelimeler

Streptomyces, Patates, Bitki patojeni, Tanı metotları