Bazı aktif maddelerin Kovid-19 için inhibisyon etkileri

Öz

Tüm dünyayı etkisi altına alan ve yayılan Kovid-19 a karşı geliştirilebilecek ilaçların ilk basamağı olan etkin aktif maddelerin seçimi için önemli olan hesapsal kimya çalışmasıyla ilgili bir kısım sonuçlardan bahsedilecek. Bu salgın hastalığa karşı gerek aşı gerekse ilaç çalışmaları tüm hızıyla devam ederken, en önemli mesele kısa zamanda doğru ilacın ortaya çıkarılmasıdır. Yaygın bir kullanımı olan Favipiravir nin oldukça etkili olduğuna dair onaylanmasa da kişisel uygulamalar olduğu ile ilgili çalışmalar vardır. Geleneksel tedavi amaçlı ve özellikle besin takviyesi olarak kullanılan çeşitli gıdaların hiç şüphesiz tarihsel sürecine baktığımızda birçok hastalığın tedavisinde kullanılmıştır ve kullanılmaktadır. Bu konuda en önemli üzerine yoğunlaşılması gereken durum hangi hastalıkta hangi etken maddenin etkili olduğunun bilinmesidir. Geleneksel tedavi amaçlı kullanılan bitkilere batığımızda; birçok çeşit ve miktarda etken madde bulunmaktadır, bunlardan en etkili olanın tespit edilmesi uzun zaman ve deneysel çalışmalar gerekmektedir bu durum ilaç tasarımında ki aşamaları oldukça uzatmaktadır. Hesaplamalı kimya ile etken maddelerin aktivitelerinin karşılaştırılması ve hangi bölgeden mikroorganizmayı veya virüsü kenetlenerek inhibe edebileceğinin önceden tespit edilmesi ilaç tasarım süreçlerini kısaltacak ve deneysel çalışmalara yön verecektir. Bu çalışmada da hali hazırda kullanılan Favipiravir bazı önemli fonksiyonel gruplara sahip etken maddelerin bu virüsü inhibe edici etkileri karşılaştırılmıştır, bu çalışma bu virüse karşı kullanılabilecek etken maddelerin en kısa zamanda tespit edilmesi ve zaman,madde kaybını önleyerek deneysel çalışmalara yön vermesi açısından önemlidir.

Anahtar Kelimeler

• Kovid-19
• Favipiravir
• Linoleik,Linolenik,Oleik,Gallik Asit

Kaynakça

1. Abu-Reidah I., M., Ali-Shtayeh M., S., Jamous R., M., Arráez-Román D., Segura-Carretero A. (2015) HPLC–DAD–ESI-MS/MS screening of bioactive components from Rhus coriaria L. (Sumac) fruits. Food Chem., 166:179-191.
2. Aktaş, A., Tüzün,B., Aslan,R., Sayin,K., Ataseven,H., (2020): New anti-viral drugs for the treatment of COVID-19 instead of favipiravir, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, DOI: 10.1080/07391102.2020.1806112.
3. Bhumi S., Palmi M., Sneha R. Sagar, (2020) In silico studies on therapeutic agents for COVID-19: Drug repurposing approach,Life Sciences,252, 117652.
4. Cai, Q., Yang, M., Liu, D., Chen, J., Shu, D., Xia, J., Liao, X., Gu, Y., Cai, Q.,Yang, Y., Shen, C., Li, X., Peng, L., Huang, D., Zhang, J., Zhang, S.,Wang, F., Liu, J., Chen, L., … Liu, L. (2020). Experimental treatmentwith favipiravir for COVID-19: An open-label control study.Engineering. https://doi.org/10.1016/j.eng.2020.03.007.
5. Durgesh K., Kamlesh K., Vijay K., V., Abhilash J., Dhiraj K., Venkatesh K. R., Rajan P., Vinod K., Sujata K. D., Ramesh C., Prashant S., (2020) Promising inhibitors of main protease of novel corona virus to prevent the spread of COVID-19 using docking and molecular dynamics simulation, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, DOI: 10.1080/07391102.2020.1779131.
6. Emanuelle M., M., João B. de A. N., Jacilene S., Cecília R. da S., Bruno C. C., Emmanuel S. M., Hélio V. N. J.,(2020) Virtual screening based on molecular docking of possible inhibitors of Covid-19 main protease,Microbial Pathogenesis, 148,2020,104365.
7. Giancarlo S., Rosa L.M., Nadjafi F., Francesco M. (2006) Hypoglycaemic Activity of Two Spices Extracts: Rhus coriaria L. and Bunium persicum Boiss. Natural Product Research, 20;20(9):882-6.
8. Jin, Z., Du, X., Xu, Y., Deng, Y., Liu, M., Zhao, Y., Zhang, B., Li, X., Zhang, L., Peng, C., Duan, Y., Yu, J., Wang, L., Yang, K., Liu, F., Jiang, R., Yang, X., You, T., Liu, X., Yang, X., Bai, F., Liu, H., Liu, X., Guddat, L.W., Xu, W., Xiao, G., Qin, C., Shi, Z., Jiang, H., Rao, Z., Yang, H.(2020), Structure of Mprofrom SARS-CoV-2 and discovery of its inhibitors, Nature 582: 289-293.

9. Khaerunnisa, S. Kurniawan, H. Awaluddin, R. Suhartati, S. Soetjipto, S. (2020) Potential Inhibitor of COVID-19 Main Protease (Mpro) From Several Medicinal Plant Compounds by Molecular Docking Study. Preprints,2020030226 (doi: 10.20944/preprints202003.0226.v1.
10. Mothay, D., Ramesh, K.V. (2020) Binding site analysis of potential protease inhibitors of COVID-19 using AutoDock. VirusDis. 31, 194–199, https://doi.org/10.1007/s13337-020-00585-z.
11. Mustard, D.,Ritche,D.W. (2005) Docking essentialdynamics eigenstructures, in:Proteins Structure Funct.,Genet., 269-274.
12. Siti K., Hendra, K., Rizki A., Suhartati S., Soetjipto S.,(2020) Potential Inhibitor of COVID-19 Main Protease (Mpro) from Several Medicinal Plant Compounds by Molecular Docking Study, doi:10.20944/preprints03.0226.v1.
13. Suyash P., Meenakshi S., V. Ravichandiran, U. S. N. Murty, Hemant K.S., (2020) Peptide-like and small-molecule inhibitors against Covid-19, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, DOI: 10.1080/07391102.2020.1757510..
14. Yılmaz,G.,Ekşi,G.,Demirci,B.,Demirci,F., (2020) Chemical Characterization Of The Fatty Acid Compositions And Antimicrobial Activity Of Sumac (Rhus Corıarıa L.) Fruits, Growing Naturally In Turkey And Sold In Herbalist MarketsJ. Fac. Pharm. Ankara, 44(1): 61-69.