EN
TR
Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi
Öz
Deneysel çalışmalarda periferik sinirin akson çapı, miyelinli sinir lifi çapı ve miyelinli sinir için iç çap/dış çap oranı (g-ratio), demiyelinizasyon, remiyelinizasyon ve sinir onarımının değerlendirilmesinde görüntü analiz programlarından yararlanılmaktadır. Bu nedenle, morfometrik değerlendirmeye sıklıkla gereksinim duyulan periferik sinir çalışmaları hedeflenerek, laboratuvarımızda yarı otomatik bir görüntü analiz programı geliştirilmiştir. Çalışmamızda, geliştirdiğimiz görüntü analiz yazılımının performansının, serbest erişimli çok amaçlı diğer bir yazılım ile güvenilirlik yönünden karşılaştırılması amaçlanmıştır. Farelerin genel anestezi altında siyatik sinirlerinden alınan doku örnekleri gluteraldehit solüsyonuna alınmıştır. Rutin elektron mikroskop takip yöntemlerinden geçirilerek epoksi resin (epoxy resin) gömülen dokulardan yarı ince kesitler alınmış ve toluidin mavisi ile boyanmıştır. Kesitler dijital kameralı ışık mikroskopta incelenmiş ve X100’lük objektifte fotoğraflanmıştır. Mikrograflar laboratuvarımızda geliştirilen Tantuna Morfometrik Ölçüm Sistemi (TanTuna Morphometric Measuring System; TT-MMS) yazılımı ile analiz edilmiştir. Seçilen iki adet ışık mikrograftan rastgele seçilen 200 adet miyelinli akson kesitinin ölçümleri program kullanılarak yapılmıştır. Aynı ölçümler ImageJ programı ile tekrarlanmış ve her iki programla elde edilen veriler istatistiksel olarak karşılaştırılmıştır. Ek bir donanıma ihtiyaç duymadan her iki yazılımın da güvenilir olduğu ve birbirleriyle uyumlu ölçümler yaptıkları saptanmıştır (p<0.001). Ayrıca her iki programın artı ve eksi yönleri belirlenerek ayrıntılı olarak açıklanmıştır. TT-MMS’nin kullanıcı dostu bir yazılım olduğu ve ölçümler için gereken süreyi de önemli ölçüde azalttığı sonucuna varılmıştır. Bu programın bir diğer önemli özelliği de kullanıcıların ihtiyaçlarına göre geliştirilmeye açık olmasıdır.
Anahtar Kelimeler
Destekleyen Kurum
Başkent Üniversitesi Tıp Fakültesi
Proje Numarası
DA 22/26
Teşekkür
Programın yazılımında ve ihtiyaca yönelik geliştirilmesinde katkılarını hiç eksik etmeyen Başkent Üniversitesi öğretim üyelerinden Biyofizik Anabilim Dalı başkanı Prof. Dr. Erhan Kızıltan ile Histoloji ve Embriyoloji Anabilim Dalı başkanı Prof. Dr. Attila Dağdeviren’e teşekkür ederim. Ayrıca çalışmanın istatistiklerinde ve yorumlanmasında katkılarını sunan Dr. Uğur Toprak PhD. ‘a teşekkürlerimi sunarım.
Kaynakça
- 1. Miller RH, Mi S. Dissecting demyelination. Nat Neurosci. 2007;10(11):1351-4.
- 2. Helvacioglu F, Dagdeviren A. Myelin ultrastructure terminology in disease and recovery processes. Arch Ital Biol. 2019;157(2-3):77-88.
- 3. Sanada LS, Tavares MR, Neubern MCM, Salgado HC, Fazan VPS. Can Wistar rats be used as the normotensive controls for nerve morphometry investigations in spontaneously hypertensive rats (SHR)? Acta CirBras. 2011;26(6):514-20.
- 4. Sanada LS, Kalil ALD, Tavares MR, Neubern MCM, Salgado HC, Fazan VPS. Sural nerve involvement in experimental hypertension: morphology and morphometry in male and female normotensive Wistar-Kyoto (WKY) and spontaneously hypertensive rats (SHR). Bmc Neuroscience. 2012;13:13-24.
- 5. Sanada LS, Tavares MR, Sato KL, et al. Association of chronic diabetes and hypertension in sural nerve morphometry: an experimental study. Diabetol & Metab Syndr. 2015;7:1-9.
- 6. Omi M, Hata M, Nakamura N, et al. Transplantation of dental pulp stem cells improves long-term diabetic polyneuropathy together with improvement of nerve morphometrical evaluation. Stem Cell Res Ther. 2017;8:279.
- 7. Arikan M, Togral G, Hasturk AE, et al. Histomorphometric and ultrastructural evaluation of long-term alpha lipoic acid and vitamin B12 use after experimental sciatic nerve injury in rats. Turk Neurosurg. 2016;26(6):944-52.
- 8. Fernandes A, Coelho T, Rodrigues A, et al. Clinicopathological correlations of sural nerve biopsies in TTR Val30Met familial amyloid polyneuropathy. Brain Commun. 2019;1(1):1-13.
Ayrıntılar
Birincil Dil
Türkçe
Konular
Biyokimya ve Hücre Biyolojisi (Diğer), Anatomi, Tıbbi ve Biyolojik Fizik
Bölüm
Araştırma Makalesi
Yazarlar
Yayımlanma Tarihi
30 Aralık 2022
Gönderilme Tarihi
22 Kasım 2022
Kabul Tarihi
29 Aralık 2022
Yayımlandığı Sayı
Yıl 2022 Cilt: 48 Sayı: 3
APA
Ayran Fidan, P. (2022). Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi. Journal of Uludağ University Medical Faculty, 48(3), 357-362. https://doi.org/10.32708/uutfd.1208692
AMA
1.Ayran Fidan P. Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi. Uludağ Tıp Derg. 2022;48(3):357-362. doi:10.32708/uutfd.1208692
Chicago
Ayran Fidan, Pınar. 2022. “Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi”. Journal of Uludağ University Medical Faculty 48 (3): 357-62. https://doi.org/10.32708/uutfd.1208692.
EndNote
Ayran Fidan P (01 Aralık 2022) Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi. Journal of Uludağ University Medical Faculty 48 3 357–362.
IEEE
[1]P. Ayran Fidan, “Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi”, Uludağ Tıp Derg, c. 48, sy 3, ss. 357–362, Ara. 2022, doi: 10.32708/uutfd.1208692.
ISNAD
Ayran Fidan, Pınar. “Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi”. Journal of Uludağ University Medical Faculty 48/3 (01 Aralık 2022): 357-362. https://doi.org/10.32708/uutfd.1208692.
JAMA
1.Ayran Fidan P. Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi. Uludağ Tıp Derg. 2022;48:357–362.
MLA
Ayran Fidan, Pınar. “Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi”. Journal of Uludağ University Medical Faculty, c. 48, sy 3, Aralık 2022, ss. 357-62, doi:10.32708/uutfd.1208692.
Vancouver
1.Pınar Ayran Fidan. Periferik Sinirlerin Histomorfometrik Analizinde TT-MMS Programının Güvenilirliğinin Karşılaştırmalı Olarak İncelenmesi. Uludağ Tıp Derg. 01 Aralık 2022;48(3):357-62. doi:10.32708/uutfd.1208692
