Van Gölü Kıyı Kumlarından İzole Edilen Spathidiid Siliyatlar (Ciliophora, Spathidiida) Üzerinde Morfolojik ve Moleküler Filogenetik Araştırmalar
Öz
Bu çalışmada Van Gölü kıyı kumlarından izole edilen bir Spathidium türünün morfolojik ve 18S rDNA gen dizisine dayalı filogenetik özellikleri araştırıldı. Kültürlerde farklı morfoloji sergileyen üç siliyat popülasyonu gözlendi. Bu popülasyonların 18S rDNA gen bölgesine ait nükleotid dizilerinin benzer olduğu görüldü ve bunların aynı türün farklı gelişim evreleri olduğuna karar verildi. 18S rDNA gen bölgesine ait nükleotid dizilerine dayalı filogenetik analizlerde bu çalışmada izole edilen Spathidium sp.’nin hemcinslerinden ziyade Lagynophrya acuminata, Enchelys gasterosterus ve Balantidion pellucidum ile birlikte kümelendikleri görüldü. Spathidiid siliyatların morfolojik sınıflandırma sistemi ile moleküler filogenisi arasında çelişkiler mevcut olup, Spathidium cinsinin parafiletik bir takson olduğu görülmektedir. Bununla birlikte tür zengini Spathidium cinsinin pek çok türü ile ilgili gen dizisinin bilinmemesi bu taksonun moleküler filogenetik durumunun açıklığa kavuşturulmasını sınırlamakta olup, farklı habitatlardan izole edilecek ayrıntılı morfolojik veriler ile birlikte farklı gen bölgelerinin de kullanılacağı filogenetik analizlere ihtiyaç duyulmaktadır.
Anahtar Kelimeler
18S rDNA gen dizisi, Filogeni, Morfoloji, Spathidium sp., Van Gölü
Destekleyen Kurum
Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi
Proje Numarası
FYL-2019-7960
Teşekkür
Bu çalışmaya FYL-2019-7960 numaralı tez projesi kapsamında maddi destek veren Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi’ne teşekkür ederiz.
Kaynakça
- Adl, S. M., Simpson, A. G. B., Farmer, M. A., Andersen, R. A., Anderson, O. R., Barta, J. R., … , & Taylor, M. F. J. R. (2005). The new higher level classification of eukaryotes with emphasis on the taxonomy of protists. Journal of Eukaryotic Microbiology, 52(5), 399 - 451. doi:10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x
- Ayres, D. L., Darling, A., Zwickl, D. J., Beerli, P., Holder, M. T., Lewis, P. O., … , & Suchard, M. A. (2012). BEAGLE: An application programming interface and high-performance computing library for statistical phylogenetics. Systematic Biology, 61, 170–173. doi:10.1093/sysbio/syr100
- Corliss, J. O. (2001). Protozoan Taxonomy and Systematics. In G. Pettis (Ed.), Encyclopedia of Life Sciences (pp. 1-7). John Wiley & Sons. doi:10.1038/npg.els.0001925
- Curds, C. R. (1983). British and Other Freshwater Ciliated Protozoa. U.S.A: Cambridge University Press.
- Darriba, D., Taboada, G. L., Doallo, R. & Posada, D. (2012). jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing. Nature Methods, 9, 772. doi:10.1038/nmeth.2109
- Foissner, W. (1991). Basic light and scanning electron microscopic methods for taxonomic studies of ciliated protozoa. European Journal of Protistology, 27(4), 313 - 330. doi:10.1016/S0932-4739(11)80248-8
- Foissner, W. (2014). An update of 'basic light and scanning electron microscopic methods for taxonomic studies of ciliated protozoa'. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 64, 271 - 292. doi:10.1099/ijs.0.057893-0
- Foissner, W., Berger, H. & Schaumburg, J. (1999). Identification and Ecology of Limnetic Plankton Ciliates. München, Germany: Informationsberichte des Bayerischen Landesamtes für Wasserwirtschaft.
- Foissner, W., & Lei, Y. L. (2004). Morphology and ontogenesis of some soil spathidiids (Ciliophora, Haptoria). Linzer biologische Beitrage, 36, 159–199.
- Foissner, W., & Xu, K. (2007). Monograph of the Spathidiida (Ciliophora, Haptoria) Vol. I: Protospathidiidae, Arcuospathidiidae, Apertospathulidae. Monographiae Biologicae, 81, 1–485.