Isparta, Hatay ve Hakkâri illerinde yonca yaprak kıvırcıklığı virüsü (alfalfa leaf curl virus; ALCV)’nün PCR yöntemi ile araştırılması
Öz
Amaç: Bu çalışmada; Isparta, Hatay ve Hakkâri illeri yonca üretim alanlarında yonca yaprak kıvırcıklığı virüsü (alfalfa leaf curl virus; ALCV)’nün bulunma durumunun moleküler yöntem ile ortaya konulması amaçlanmıştır. Materyal ve Yöntem: 2019-2020 yılları arasında Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi ile Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi Ziraat Fakülteleri’nin yonca uygulama alanlarından ve Hakkâri ilinde (Otluca Köyü) bulunan doğal alanlardan temin edilen yonca örnekleri ile çalışma yürütülmüştür. Çalışmada ALCV ile enfekte olduğu düşünülen 50 yaprak örneği toplanmıştır. ALCV’nin varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (Polymerase Chain Reaction: PCR) yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. PCR uygulaması, ALCV’nin kılıf protein (Coat Protein: CP) genine spesifik 267 nükleotid uzunluğundaki gen bölgesinin çoğaltılması için gerçekleştirilmiştir. Araştırma Bulguları: PCR çalışmaları sonucunda incelenen örneklerde ALCV tespit edilememiştir. Sonuç: Bu çalışma, yonca bitkisinde ALCV’nin araştırılması bakımından ilk çalışma niteliğindedir.
Anahtar Kelimeler
Destekleyen Kurum
Hakkari Üniversitesi
Proje Numarası
Proje No: FM20BAP4
Teşekkür
Bu çalışma Hakkari Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından finansal olarak desteklenmiştir (Proje No: FM20BAP4).
Kaynakça
- Davoodi, Z., Bejerman, N., Richet, C., Filloux, D.,, S.G., Chatzivassiliou, E.K., Galzi, S., Julian, C., Samarfard, S., Trucco, V., Giolitti, F., Fiallo-Olivé, E., Navas-Castillo, J., Asaad, N., Moukahel, A.R, Hijazi, J., Mghandef, S., Heydarnejad, J., Massumi, H., Varsani, A., Dietzgen, R.G., Harkins, G.W. , Martin, D.P. & Roumagnac, P. (2018a). The Westward Journey of Alfalfa Leaf Curl Virus, Viruses, 10, 542; DOI:10.3390/v10100542.
- Davoodi, Z., Heydarnejad, J., Massumi, H., Richet, C., Galzi, S., Filloux, D. & Roumagnac, P. (2018b). First report of alfalfa leaf curl virus from alfalfa in iran. Plant Dis.; 2385.
- Bernardo, P., Muhire, B., Francois, S., Deshoux, M., Hartnady, P., Farkas, K., Kraberger, S., Filloux, D., Fernandez, E., Galzi, S., Ferdinand, R., Granier, M., Marais, A., Monge Blasco, P., Candresse, T., Escriu, F., Varsani, A., Harkins, G.W., Martin, D.P. & Roumagnac, P. (2016). Molecular characterization and prevalence of two capulaviruses: alfalfa leaf curl virus from France and euphorbia caputmedusae latent virus from South Africa. Virology, 493: 142-153.