Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi

Ömer Faruk Coşkun; Osman Gülşen; Akife Dalda Şekerci; Halit Yetişir; Hasan Pınar

TR

Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi

Öz

Bu araştırmada farklı kabak genotiplerinde çalışabilecek SSR primer kombinasyonlarını belirlemek amaçlanmıştır. Çalışmada agronomik özellikler bakımından seçilen 47 çerezlik kabak genotipinde daha önce çeşitli kabakgil türlerinde geliştirilen toplam 79 SSR primer kombinasyonu test edilmiştir. Farklı genotiplerin DNA’larının karıştırılmasıyla elde edilen DNA, bütün primerlerle test edilmiştir. Bütün primerlerden 16 adedinin güvenilir bant verdiği belirlenmiştir. Bu çalışmadan elde edilen bulgular başarılı bulunan primerlerin ilişki haritalaması, safiyet testlemesi ve yeni markır geliştirme çalışmalarında kullanılabileceğini göstermiştir.

Anahtar Kelimeler

Çerezlik kabak,SSR,moleküler karakterizasyon

Kaynakça

Blagrove, R., Lilley, G. 1980. Characterisation of cucurbitin from various species of the Cucurbitaceae. European Journal of Biochemistry, 103: 577-584.
Danin-Poleg, Y., Reis, N., Tzuri, G., Katzir, N. 2001. Development and characterization of microsatellite markers in Cucumis. Theor. Appl. Genet., 102: 61-72.
Doyle, J.J., Doyle, J.L. 1990. Isolation of Plant DNA from fresh tissue. Focus. 12: 13-15.
Ermiş, S. 2010. Ekolojinin kabuklu ve kabuksuz çekirdek kabak (Cucurbita pepo L.) hatlarında tohum verimi ve çerezlik kalitesine etkisi. Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı, Ankara, 153 s. (Basılmamış Doktora Tezi).
Gong, L., Paris, H.S., Nee, M.H., Stift, G., Pachner, M., Vollmann, J., Lelley, T., 2012. Genetic relationships and evolution in Cucurbita pepo (pumpkin, squash, gourd) as revealed by simple sequence repeat polymorphisms. Theor. Appl. Genet., 124: 875-891.
Gupta, P.K., Varshney, R.K. 2000. The Development and Use of Microsatellite Markers for Genetic Analysis and Plant Breeding with Emphasis on Bread Wheat. Euphytica, 163-185.
Jarret, R.L., Merrick, L.C., Holms, T., Evans, J., Aradhya, M.K. 1997. Simple Sequence Repeats in Watermelon (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai). Genome, 40(4): 433-441.
Katzir, N., Portnoy, V., Yonash, N., Mozes-Daube, N., Tzuri, G., Paris, H.S. 2002. Use of AFLP, ISSR, and SSR marker systems to assess genetic diversity in Cucurbita pepo. In: Plant, Animal and Microbe Genomes Conference X, vol. 10, San Diego, California, 121p.
Katzir, N., Tadmor, Y., Tzuri, G., Leshzashen, E., Mozes-Daube, N., Danin-Poleg, Y., Paris, H.S. 2000. Further ISSR and preliminary SSR analysis of relationships among accessions of Cucurbita pepo. In: Katzir, N., Paris, H.S. (Eds.), Proc Cucurbitaceae 2000. Acta. Hortic., 510: 433-439.
López-Sesé, A.I., Staub, J., Katzir, N., Gómez-Guillamón, L.S. 2002. Estimation of Between and Within Accession Varation in Selected Spanish Melon Germplasm Using RAPD and SSR Markers to Assess Strategies for Large Collection Evalution. Euphytica ,127: 41-51.

Marcone, M. 1999. Biochemical and biophysical properties of plant storage proteins: a current understanding with emphasis on 11S seed globulins. Food Research International, 32: 79-92.
Nimmakayala, P., Tomason, R.Y., Jeong, J., Ponniah, K.S., Karunathilake, A., Levi, A., Perumal, R., Reddy, K.U. 2009. Genetic Reticulation and Interrelationships Among Citrullus Species as Revealed by Joint Analysis of Shared AFLPs and Species-Specific SSR Alleles. Plant Genetic Resources Characterization and Utilization, 1-10.
Paris, H.S., Yonah, N., Portnoy, V., Mozes-Dauble, N., Tzuri, N., Katzir, N. 2003. Assesment of genetic relationships in Cucurbita pepo (Cucurbitaceae) using DNA markers. Theor. Appl. Genet., 106:971-978.
Paris, H.S. 2004. AFLP, ISSR, and SSR polymorphisms are in accordance with botanical and Cultivated plant taxonomies of the highly polymorphic Cucurbita pepo. Acta Hort., 634:167-171.
Robinson, R.W., Decker-Walters, D.S. 1997. Cucurbits. In: Crop Production Department of Horticultural Science. Cornell Univ., The Cucurbit Network U.S.A
Staub, J.E, Danin-Poleg, Y., Fazio, G., Horejsi, T., Reis, N., Katzir, N. 2000. Comparative Analysis of Cultivated Melon Groups (Cucumis melo L.) Using Random Amplified Polymorphic DNA and Simple Sequence Repeat Markers. Euphytica, 115: 225-241.
Szabó, Z., Gyulai, G., Humphreys, M., Horváth, L., Bittansánszky, A., Lágler, R., Heszky, L. 2005. Genetic Variation of Melon (C. melo) Compared to an Extinct Landrace from the Middle Ages (Hungary).I. rDNA, SSR and SNP Analysis of 47 Cultivars. Euphytica, 146: 87-94.
Tzitzikas, E.M., Monforte, A.J., Fatihi, A., Kypriotakis, A., Iacovides, T.A., Ioannides, I.M., Kalaitzis, P. 2009. Genetic Diversity and Population Structure of Traditional Greek and Cypriot Melon Cultigens (Cucumis melo L.) Based on Simple Sequence Repeat Variability. HortScience, 44(7): 1820-1824.
TÜİK, 2015. Türkiye İstatistik Kurumu bitkisel üretim veritabanları. http://tuikapp.tuik.gov.tr.
Watcharawongpaibon, N., Chunwongse, J. 2008. Development and Characterization of Microsatellite Markers from an Enriched Genomic Library of Cucumber (Cucumis sativus). Plant Breeding, 127: 74-81.
Yıldırım, A., Kandemir, N. 2001. Genetik markörler ve analiz metodları. Bitki biyoteknolojisi II Genetik Mühendisliği ve Uygulamaları, Ed: Özcan S, Gürel E, Babaoğlu M., Selçuk Üniversitesi Basımevi.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yazarlar

Ömer Faruk Coşkun ^*

Osman Gülşen Bu kişi benim

Akife Dalda Şekerci Bu kişi benim

Halit Yetişir Bu kişi benim

Hasan Pınar Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi

1 Haziran 2017

Gönderilme Tarihi

14 Ekim 2016

Kabul Tarihi

-

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2017 Cilt: 6

IZ

https://izlik.org/JA59ER64KE

APA

Coşkun, Ö. F., Gülşen, O., Dalda Şekerci, A., Yetişir, H., & Pınar, H. (2017). Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi. Akademik Ziraat Dergisi, 6, 151-156. https://izlik.org/JA59ER64KE

AMA

1.Coşkun ÖF, Gülşen O, Dalda Şekerci A, Yetişir H, Pınar H. Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi. Akademik Ziraat Dergisi. 2017;6:151-156. https://izlik.org/JA59ER64KE

Chicago

Coşkun, Ömer Faruk, Osman Gülşen, Akife Dalda Şekerci, Halit Yetişir, ve Hasan Pınar. 2017. “Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi”. Akademik Ziraat Dergisi 6 (Haziran): 151-56. https://izlik.org/JA59ER64KE.

EndNote

Coşkun ÖF, Gülşen O, Dalda Şekerci A, Yetişir H, Pınar H (01 Haziran 2017) Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi. Akademik Ziraat Dergisi 6 151–156.

IEEE

[1]Ö. F. Coşkun, O. Gülşen, A. Dalda Şekerci, H. Yetişir, ve H. Pınar, “Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi”, Akademik Ziraat Dergisi, c. 6, ss. 151–156, Haz. 2017, [çevrimiçi]. Erişim adresi: https://izlik.org/JA59ER64KE

ISNAD

Coşkun, Ömer Faruk - Gülşen, Osman - Dalda Şekerci, Akife - Yetişir, Halit - Pınar, Hasan. “Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi”. Akademik Ziraat Dergisi 6 (01 Haziran 2017): 151-156. https://izlik.org/JA59ER64KE.

JAMA

1.Coşkun ÖF, Gülşen O, Dalda Şekerci A, Yetişir H, Pınar H. Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi. Akademik Ziraat Dergisi. 2017;6:151–156.

MLA

Coşkun, Ömer Faruk, vd. “Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi”. Akademik Ziraat Dergisi, c. 6, Haziran 2017, ss. 151-6, https://izlik.org/JA59ER64KE.

Vancouver

1.Ömer Faruk Coşkun, Osman Gülşen, Akife Dalda Şekerci, Halit Yetişir, Hasan Pınar. Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi. Akademik Ziraat Dergisi [Internet]. 01 Haziran 2017;6:151-6. Erişim adresi: https://izlik.org/JA59ER64KE

Bazı çerezlik kabak hatlarında SSR markır analizi

Öz

Anahtar Kelimeler

Öz

Kaynakça

Ayrıntılar

Birincil Dil

Konular

Bölüm

Yazarlar

Yayımlanma Tarihi

Gönderilme Tarihi

Kabul Tarihi

Yayımlandığı Sayı

IZ

Kaynak Göster