Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings

Zühtü Polat; Didem Canik Orel; Kutay Coşkun Yıldırım

doi:10.53471/bahce.1976658

EN TR

Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings

Öz

Fusarium crown and root rot, caused by Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici (FORL), is a Fusarium crown and root rot, caused by Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici (FORL), is a destructive soil-borne disease of tomato and other solanaceous crops. This two-year study evaluated whether seed microbiome modification via flowering-stage inoculation with endophytic bacteria could protect tomato and eggplant seedlings against FORL, compared with conventional direct seed coating. Seeds from parent plants inoculated at flowering with Pseudomonas fluorescens L5b or Pseudomonas gessardii L13 (L5-B, L13) were compared with directly coated seeds (K-L5-B, KL-13). Seedlings were challenged with FORL and assessed six weeks later. In eggplant, K-L5-B achieved the greatest disease reduction in both years (19.44% and 24.56%), while L13 failed to suppress disease in year one. In tomato, K-L5-B reduced disease severity from 64.88% (positive control) to 46.40% (28.48% reduction), followed by KL-13 (24.49%), L13 (20.83%), and L5-B (18.02%). Bacterial treatments partially mitigated FORL-induced growth impairment, especially for chlorophyll content and shoot fresh weight. In eggplant, KL-13 increased shoot fresh weight to 27.15 g, exceeding the positive control (22.13 g) and approaching the healthy control (26.19 g). Principal component analysis explained 84.3% of growth variation, with biomass traits driving treatment separation. Overall, flowering-stage inoculation produced seeds with biologically meaningful protective capacity, but direct bacterial seed coating provided more consistent protection under severe FORL pressure.

Anahtar Kelimeler

Destekleyen Kurum

This research was funded by The Scientific and Technological Research Council of Türkiye (Project no: 119O687)

Etik Beyan

The authors declare that there are no conflicts of interest among themselves or with the institutions involved in the data collection process.

Çiçeklenme Dönemi İnokülasyonu ile Tohum Mikrobiyomu Modifikasyonu ve Doğrudan Bakteriyel Tohum Kaplama, Domates ve Patlıcan Fidelerinde Fusarium Kök ve Kökboğazı Çürüklüğüne Karşı Orta Düzeyde Koruma Sağlar

Öz

Fusarium kök ve kökboğazı çürüklüğü (Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici – FORL), domates ve diğer solanaceae türlerinde yıkıcı kayıplara yol açan toprak kökenli bir hastalıktır. Bu iki yıllık çalışmada, çiçeklenme döneminde endofitik bakteri inokülasyonu yoluyla tohum mikrobiyomunun değiştirilmesinin domates ve patlıcan fidelerini FORL'a karşı koruyup koruyamayacağı, geleneksel doğrudan tohum kaplama yöntemiyle karşılaştırılarak değerlendirilmiştir. Çiçeklenmede Pseudomonas fluorescens L5b veya Pseudomonas gessardii L13 ile inoküle edilen ana bitkilerden elde edilen tohumlar (L5-B, L13), aynı suşlarla doğrudan kaplanan tohumlarla (K-L5-B, KL-13) karşılaştırılmıştır. Fideler FORL ile inoküle edilmiş ve altı hafta sonra değerlendirilmiştir. Patlıcanda K-L5-B her iki yılda da en yüksek hastalık azalımını sağlarken (%19,44 ve %24,56), L13 ilk yıl hastalığı baskılayamamıştır. Domateste K-L5-B hastalık şiddetini pozitif kontrolde %64,88'ten %46,40'a düşürmüş (%28,48 azalım), bunu KL-13 (%24,49), L13 (%20,83) ve L5-B (%18,02) izlemiştir. Bakteri uygulamaları FORL kaynaklı gelişme geriliğini kısmen hafifletmiş, özellikle klorofil SPAD değeri ve gövde yaş ağırlığında iyileşme sağlamıştır. Patlıcanda KL-13 gövde yaş ağırlığını 27,15 g'a yükselterek pozitif kontrolü (22,13 g) aşmış ve sağlıklı kontrole (26,19 g) yaklaşmıştır. Temel bileşen analizi, büyüme varyasyonunun %84,3'ünü açıklamış ve uygulamalar arası ayrımda biyokütle özelliklerinin belirleyici olduğunu göstermiştir. Genel olarak, çiçeklenme dönemi inokülasyonu biyolojik açıdan anlamlı koruma sağlayan tohumlar oluşturmuş; ancak şiddetli FORL baskısı altında en tutarlı koruma doğrudan bakteriyel tohum kaplama ile elde edilmiştir.

Anahtar Kelimeler

Destekleyen Kurum

Bu araştırma, Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu (TÜBİTAK) tarafından 119O687 proje numarası ile desteklenmiştir.

Etik Beyan

Yazarlar arasında veya verilerin toplandığı kurumlarla herhangi bir çıkar çatışması bulunmamaktadır.

Kaynakça

Abdallah, R. A. B., Jabnoun-Khiareddine, H., Nefzi, A., Ayed, F., & Daami-Remadi, M. (2019). Field suppression of Fusarium wilt and microbial population shifts in tomato rhizosphere following soil treatment with two selected endophytic bacteria. Eurasian Journal of Soil Science, 8(3), 208–220. https://doi.org/10.18393/ejss.556780
Alabouvette, C., Lemanceau, P., & Steinberg, C. (1993). Recent advances in the biological control of Fusarium wilts. Pesticide Science, 37(4), 365–373. https://doi.org/10.1002/ps.2780370409
Altınok, H. H., Can, C., Dikilitaş, M., & Çolak, H. (2012). Türkiye’de açık tarla patlıcan yetiştiriciliğinde Fusarium solgunluk hastalığının yaygınlığı ve izolatların virülenslikleri. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 16(3), 342–352.
Ateş, C., Fidan, H., Karacaoğlu, M., & Daşgan, H. (2019). The identification of the resistance levels of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici and Tomato yellow leaf curl viruses in different tomato genotypes with traditional and molecular methods. Applied Ecology and Environmental Research, 17(2), 2203–2218. https://doi.org/10.15666/aeer/1702_22032218
Bergna, A., Cernava, T., Rändler, M., Grosch, R., Zachow, C., & Berg, G. (2018). Tomato seeds preferably transmit plant beneficial endophytes. Phytobiomes Journal, 2(4), 183–193. https://doi.org/10.1094/PBIOMES-06-18-0029-R
Bolwerk, A., Lagopodi, A. L., Wijfjes, A. H. M., Lamers, G. E. M., Chin-A-Woeng, T. F. C., Lugtenberg, B. J. J., & Bloemberg, G. V. (2003). Interactions in the tomato rhizosphere of two Pseudomonas biocontrol strains with the phytopathogenic fungus Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. Molecular Plant-Microbe Interactions, 16(11), 983–993. https://doi.org/10.1094/MPMI.2003.16.11.983
Cabral, C., Gonçalves, A., Fonseca, M., Urben, A., Costa, H., Lourenço, V., Boiteux, L., & Reis, A. (2020). First detection of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici across major tomato-producing regions in Brazil. Phytoparasitica, 48, 545–553. https://doi.org/10.1007/s12600-020-00824-5
Can, C., Yucel, S., Korolev, N., & Katan, T. (2004). First report of Fusarium crown and root rot of tomato caused by Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici in Turkey. Plant Pathology, 53, 814. https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2004.01087.x

Chin-A-Woeng, T. F. C., Bloemberg, G. V., van der Bij, A. J., van der Drift, K. M. G. M., Schripsema, J., Kroon, B., Scheffer, R. J., Keel, C., Bakker, P. A. H. M., Tichy, H. V., de Bruijn, F. J., Thomas-Oates, J. E., & Lugtenberg, B. J. J. (1998). Biocontrol by phenazine-1-carboxamide-producing Pseudomonas chlororaphis PCL1391 of tomato root rot caused by Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. Molecular Plant-Microbe Interactions, 11(11), 1069–1077. https://doi.org/10.1094/MPMI.1998.11.11.1069
Chin-A-Woeng, T. F. C., Bloemberg, G. V., Mulders, I. H. M., Dekkers, L. C., & Lugtenberg, B. J. J. (2000). Root colonization by phenazine-1-carboxamide-producing bacterium Pseudomonas chlororaphis PCL1391 is essential for biocontrol of tomato foot and root rot. Molecular Plant-Microbe Interactions, 13(12), 1340–1345. https://doi.org/10.1094/MPMI.2000.13.12.1340
Çakır, B., Gül, A., Yolageldi, L., & Özaktan, H. (2014). Response to Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici in tomato roots involves regulation of SA- and ET-responsive gene expressions. European Journal of Plant Pathology, 139, 379–391. https://doi.org/10.1007/s10658-014-0394-9
Çolak, A., & Biçici, M. (2011). Doğu Akdeniz Bölgesi örtü altı domates yetiştiriciliğinde Fusarium oxysporum spesiyal formlarının simptomatolojik ayrımı ile solgunluk ve kök-kök boğazı çürüklüğü hastalıklarının çıkış, şiddet ve yaygınlıklarının belirlenmesi. Bitki Koruma Bülteni, 51(4), 331–345.
de Weert, S., Kuiper, I., Lagendijk, E. L., Lamers, G. E. M., & Lugtenberg, B. J. J. (2004). Role of chemotaxis toward fusaric acid in colonization of hyphae of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici by Pseudomonas fluorescens WCS365. Molecular Plant-Microbe Interactions, 17(11), 1185–1191. https://doi.org/10.1094/MPMI.2004.17.11.1185
Kamilova, F., Kravchenko, L. V., Shaposhnikov, A. I., Azarova, T., Makarova, N., & Lugtenberg, B. (2006). Effects of the tomato pathogen Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici and of the biocontrol bacterium Pseudomonas fluorescens WCS365 on the composition of organic acids and sugars in tomato root exudate. Molecular Plant-Microbe Interactions, 19(10), 1121–1126. https://doi.org/10.1094/MPMI-19-1121
Kamilova, F., Lamers, G., & Lugtenberg, B. (2008). Biocontrol strain Pseudomonas fluorescens WCS365 inhibits germination of Fusarium oxysporum spores in tomato root exudate as well as subsequent formation of new spores. Environmental Microbiology, 10(9), 2455–2461. https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2008.01638.x Kamilova, F., Validov, S., Azarova, T., Mulders, I., & Lugtenberg, B. (2005). Enrichment for enhanced competitive plant root tip colonizers selects for a new class of biocontrol bacteria. Environmental Microbiology, 7(11), 1809–1817. https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2005.00889.x
Kamou, N. N., Karasali, H., Menexes, G., Kasiotis, K. M., Bon, M. C., Papadakis, E. N., Tzelepis, G. D., & Lagopodi, A. L. (2015). Isolation, screening and characterisation of local beneficial rhizobacteria based upon their ability to suppress Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici and tomato foot and root rot. Biocontrol Science and Technology, 25(8), 928–949. https://doi.org/10.1080/09583157.2015.1020762
King, E. O., Ward, M. K., & Raney, D. E. (1954). Two simple media for the demonstration of pyocyanin and fluorescin. Journal of Laboratory and Clinical Medicine, 44(2), 301–307.
Manzo, D., Ferriello, F., Puopolo, G., Zoina, A., D’Esposito, D., Tardella, L., Ferrarini, A., & Ercolano, M. R. (2016). Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici induces distinct transcriptome reprogramming in resistant and susceptible isogenic tomato lines. BMC Plant Biology, 16, Article 53. https://doi.org/10.1186/s12870-016-0740-5 McGovern, R. J. (2015). Management of tomato diseases caused by Fusarium oxysporum. Crop Protection, 73, 78–92. https://doi.org/10.1016/j.cropro.2015.02.021
Mitter, B., Pfaffenbichler, N., Flavell, R., Compant, S., Antonielli, L., Petric, A., Berninger, T., Naveed, M., Sheibani-Tezerji, R., von Maltzahn, G., & Sessitsch, A. (2017). A new approach to modify plant microbiomes and traits by introducing beneficial bacteria at flowering into progeny seeds. Frontiers in Microbiology, 8, Article 11. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.00011
Mohamed, D., Gaston, K., Guy, B., Carine, N., Aicha, K., & Daouda, K. (2021). Efficacy of four essential oils on Fusarium head blight caused by Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, a fungal telluric pathogen of tomato grown under cover. International Journal of Advanced Research, 9(11), 1018–1030. https://doi.org/10.21474/ijar01/13835
Nefzi, A., Abdallah, R. A. B., Jabnoun-Khiareddine, H., Medimagh-Saidana, S., Haouala, R., & Daami-Remadi, M. (2016). Antifungal activity of aqueous and organic extracts from Withania somnifera L. against Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. Journal of Microbial & Biochemical Technology, 8(3), 144–150. https://doi.org/10.4172/1948-5948.1000277
Nurlila, R. U., La Fua, J., Abidin, M. S., Sulaeha, S., & Hadju, L. (2022). Effectiveness of endophytic bacteria from local tomato plants against wilt disease caused by Fusarium oxysporum. Caraka Tani: Journal of Sustainable Agriculture, 38(1), 53–64.
Pirayesh, S., Zamanizadeh, H., & Morid, B. (2018). Molecular identification of physiological races of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici and radicis-lycopersici causal agent of Fusarium wilt of tomato in Iran. Journal of Agricultural Science and Technology, 20, 193–202.
R Core Team. (2025). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. https://www.R-project.org/
Ramachela, K., Mpaneng, M. A., Mathuthu, M., & Zeevaart, J. R. (2021). Responses of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici (FORL) to ZnNO₃ under in vitro conditions. Pakistan Journal of Phytopathology, 33(1), 29–35.
Ramírez, V., Martínez, J., Bustillos-Cristales, M. D. R., Castañeda-Antonio, D., Munive, J. A., & Baez, A. (2022). Bacillus cereus MH778713 elicits tomato plant protection against Fusarium oxysporum. Journal of Applied Microbiology, 132(1), 470–482. https://doi.org/10.1111/jam.15179
Saikia, B., Bhattacharyya, A., Boro, R. C., & Savani, A. K. (2025). Bioprospecting of bacterial endophytes from Solanum pimpinellifolium with antifungal activity against Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici causing vascular wilt. Physiological and Molecular Plant Pathology, 136, Article 102566. https://doi.org/10.1016/j.pmpp.2025.102566
Sankar, P. M., Raguchander, T., & Shanmugabackiam, S. (2017). Seed bacterization: A novel prime tool for growth promotion in tomato (Solanum lycopersicum M.) under in vitro. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences, 6(11), 3076–3080.
Taiebikhah, N., Mirtalebi, M., & Gharin, R. (2026). Antagonistic potential of arugula vermicompost-derived fungi for controlling tomato crown and root rot caused by Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. Physiological and Molecular Plant Pathology, 141, Article 102982. https://doi.org/10.1016/j.pmpp.2025.102982
Townsend, G. R., & Heuberger, J. W. (1943). Methods for estimating losses caused by diseases in fungicide experiments. Plant Disease Reporter, 27(17), 340–343.
Tunalı, B., Tosun, C., Maldar, B. M., Meyva, G., & Kansu, B. (2018). Bazı antagonist Trichoderma ve endofitik Acremonium izolatlarının Fusarium kök ve kök-boğazı çürüklüğü hastalıklarına karşı etkinliklerinin belirlenmesi. Türk Tarım-Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi, 6(3), 266–272. https://doi.org/10.24925/turjaf.v6i3.266-272.1613
Validov, S., Kamilova, F., Qi, S., Stephan, D., Wang, J. J., Makarova, N., & Lugtenberg, B. (2007). Selection of bacteria able to control Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici in stonewool substrate. Journal of Applied Microbiology, 102(2), 461–471. https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2006.03083.x
Yang, Y., Wang, Y., Gao, J., Shi, Z., Chen, W., Huangfu, H., Li, Z., & Liu, Y. (2024). Characterisation of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici in infected tomatoes in Inner Mongolia, China. Journal of Fungi, 10(9), Article 622. https://doi.org/10.3390/jof10090622
Yıldırım, K. C., Canik Orel, D., Okyay, H., Gürsan, M. M., & Demir, İ. (2021). Quality of immature and mature pepper (Capsicum annuum L.) seeds in relation to bio-priming with endophytic Pseudomonas and Bacillus spp. Horticulturae, 7(4), Article 75. https://doi.org/10.3390/horticulturae7040075
Yıldırım, K. C., Canik Orel, D., Okyay, H., Gürsan, M. M., & Yıldız, G. (2025). Enhancing seed quality and plant growth through modification of seed microbiome with beneficial endophytic bacteria. Scientia Horticulturae, 354, Article 114531. https://doi.org/10.1016/j.scienta.2025.114531
Zhang, Z., Li, J., Zhang, Z., Liu, Y., & Wei, Y. (2021). Tomato endophytic bacteria composition and mechanism of suppressiveness of wilt disease (Fusarium oxysporum). Frontiers in Microbiology, 12, Article 731764. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.731764

Ayrıntılar

Birincil Dil

İngilizce

Konular

Sebze Yetiştirme ve Islahı

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yazarlar

Zühtü Polat ^*
0000-0002-4630-6940
Türkiye

Didem Canik Orel
0000-0001-8140-379X
Türkiye

Kutay Coşkun Yıldırım
0000-0002-5762-8128
Türkiye

Yayımlanma Tarihi

23 Ekim 2026

Gönderilme Tarihi

29 Haziran 2026

Kabul Tarihi

28 Eylül 2026

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2026 Cilt: 55 Sayı: 2

DOI

https://doi.org/10.53471/bahce.1976658

IZ

https://izlik.org/JA23BZ84HS

Kaynak Göster

RIS / Bibtex

APA

Polat, Z., Canik Orel, D., & Yıldırım, K. C. (2026). Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings. Bahçe, 55(2). https://doi.org/10.53471/bahce.1976658

AMA

1.Polat Z, Canik Orel D, Yıldırım KC. Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings. Bahçe. 2026;55(2). doi:10.53471/bahce.1976658

Chicago

Polat, Zühtü, Didem Canik Orel, ve Kutay Coşkun Yıldırım. 2026. “Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings”. Bahçe 55 (2). https://doi.org/10.53471/bahce.1976658.

EndNote

Polat Z, Canik Orel D, Yıldırım KC (01 Ekim 2026) Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings. Bahçe 55 2

IEEE

[1]Z. Polat, D. Canik Orel, ve K. C. Yıldırım, “Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings”, Bahçe, c. 55, sy 2, Eki. 2026, doi: 10.53471/bahce.1976658.

ISNAD

Polat, Zühtü - Canik Orel, Didem - Yıldırım, Kutay Coşkun. “Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings”. Bahçe 55/2 (01 Ekim 2026). https://doi.org/10.53471/bahce.1976658.

JAMA

1.Polat Z, Canik Orel D, Yıldırım KC. Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings. Bahçe. 2026;55. doi:10.53471/bahce.1976658.

MLA

Polat, Zühtü, vd. “Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings”. Bahçe, c. 55, sy 2, Ekim 2026, doi:10.53471/bahce.1976658.

Vancouver

1.Zühtü Polat, Didem Canik Orel, Kutay Coşkun Yıldırım. Seed microbiome modification through flowering-stage inoculation and direct bacterial seed coating confer moderate protection against Fusarium crown and root rot in tomato and eggplant seedlings. Bahçe. 01 Ekim 2026;55(2). doi:10.53471/bahce.1976658

BAHÇE YAZAR KILAVUZU

Aşağıdaki bağlantıdan “Makale Şablonunu” indirebilirsiniz:

📝 BAHCE - Article Template [Makale Şablonu] [tr] (r2026.09.01).docx

1. Sayfa Düzeni Ve Yazı Karakteri

Makaleler A4 boyutunda, her taraftan 2,5 cm boşluk bırakılacak şekilde Word dosyası olarak hazırlanmalıdır. Yazı tipi Calibri, 11 punto ve tek satır aralığı kullanılmalıdır. Paragrafların ilk satırı 1 cm içeriden başlamalı, paragraflar arasında boşluk bırakılmamalıdır. Makale tek sütun halinde düzenlenmelidir. Şekil ve Çizelgeler dahil toplam sayfa sayısı 15’i geçmemelidir.

2. Makalenin Bölümleri ve Sıralaması

Makale metni sırasıyla; Türkçe Başlık, yazar(lar)ın adı-soyadı, kurum/adres bilgileri ve ORCID numaraları, Öz, Anahtar Kelimeler, İngilizce Başlık, Abstract, Keywords, Metin (Giriş, Materyal ve Metot, Bulgular, Tartışma, Sonuç), Teşekkür (varsa), Etik Beyan, Çıkar Çatışması, Finansal Destek ve Kaynaklar bölümlerinden oluşmalıdır. Etik Beyan, Çıkar Çatışması ve Finansal Destek bölümleri zorunludur ve Kaynaklar’dan hemen önce, bu sırayla verilmelidir.

3. Makale Başlığı

Makalenin Türkçe ve İngilizce başlığı 14 punto olacak şekilde yazılmalıdır.

4. Yazar Bilgileri

Başlığın altına yazar(lar)ın ad ve soyadları yazılmalıdır. Yazar(lar)ın ünvanı, kurum/adres bilgileri ve ORCID numaraları, yazar isimlerinin altında bir satır boşluk bırakılarak verilmelidir. Yazar isimleri 11 punto, kurum/adres ve ORCID numaraları 9 punto ile yazılmalıdır. Sorumlu yazara ait e-posta adresi ilk sayfada dipnot olarak verilmelidir.

5. Öz Ve Anahtar Kelimeler (Abstract Ve Keywords)

Türkçe Öz, yazar(lar)ın isim/kurum/ORCID bilgilerinin altında yer almalı ve 200 kelimeyi geçmemelidir. Öz’ün altında Anahtar Kelimeler verilmelidir. Ardından makalenin İngilizce başlığı ve Abstract (200 kelimeyi geçmeyecek şekilde) yazılmalı ve hemen altına Keywords eklenmelidir. Anahtar kelime sayısı 3 ile 5 arasında olmalıdır.

6. Metin Yapısı ve Başlıklandırma

Metin genel olarak; a) Giriş, b) Materyal ve Metot, c) Bulgular, d) Tartışma, e) Sonuç/lar, f) Teşekkür (varsa), g) Etik Beyan, h) Çıkar Çatışması, i) Finansal Destek, j) Kaynaklar bölümlerinden oluşmalıdır. İstenirse c ve d bölümleri “Bulgular ve Tartışma” başlığı altında birleştirilebilir. Derleme makaleler, materyal/metot/bulgular başlıkları kullanılmadan diğer kurallara uyumlu olarak hazırlanabilir; ancak beyan bölümleri derlemelerde de zorunludur.

Ana başlıklar koyu ve BÜYÜK HARFLE; ikinci derece başlıklar koyu, italik ve Her Sözcük Büyük Harf ile Başlar; üçüncü derece başlıklar ise Tümce düzeninde ve italik olarak verilmelidir. Ana başlıklar üstten iki, alttan bir satır boşlukla; ikinci derece başlıklar üstten ve alttan birer satır boşlukla; üçüncü derece başlıklar boşluksuz satır olarak yer almalıdır. Paragraflar 1 cm içeriden başlamalıdır.

Pratik bilgi: Makale Şablonu'nda bu biçimler hazır Word stilleri olarak tanımlıdır (Başlık 1, Başlık 2, Başlık 3; ayrıca Yazar, Kurum-Adres ve Öz/Abstract Etiketi stilleri). Başlığınızı veya paragrafınızı yazdıktan sonra Word'ün Stiller panelinden ilgili stili seçmeniz yeterlidir; elle kalınlaştırma, büyük harfe çevirme, italik yapma veya boşluk/girinti ayarlama gibi işlemlere gerek yoktur. Stillerin kullanılması, mizanpaj sürecinin hızlı ve hatasız ilerlemesini sağlar.

7. Bölüm İçerikleri (Özet Açıklama)

GİRİŞ: Sorun ve çalışmanın başlangıcındaki durum kısaca ortaya konulmalı; konuya uygun ve gerekli literatür bilgileri verilmeli; bölüm sonunda araştırmanın amacı belirtilmelidir.

MATERYAL VE METOT: Kullanılan materyal ve uygulanan metot kısa, açık ve öz biçimde yazılmalı; materyal ve metot alt başlıklar halinde verilmelidir.

BULGULAR: Bulguların sunumunda metin, çizelge ve şekiller birbirini tamamlayıcı olmalıdır.

TARTIŞMA: Sonuçlar daha önceki çalışmalarla karşılaştırılmalı; farklar/genellemeler ortaya konulmalı; girişte belirtilen amaç ile sonuçlar ilişkilendirilerek literatür ışığında tartışılmalıdır.

SONUÇ/LAR: Bulgular bilime/uygulamaya katkı yönünden değerlendirilerek öneriler şeklinde ifade edilmelidir.

8. Beyanlar (Etik Beyan, Çıkar Çatışması, Finansal Destek)

Kaynaklar bölümünden hemen önce, aşağıdaki üç beyan ana başlık düzeyinde ve bu sırayla verilmelidir. Üçü de zorunludur; ilgili durum söz konusu değilse olumsuz beyan yazılmalıdır. Beyanların eksik olduğu makaleler ön kontrolde yazara geri gönderilir.

ETİK BEYAN: Etik kurul izni gerektiren çalışmalarda kurulun adı ile karar tarihi ve sayısı belirtilmelidir (örn. “Bu çalışma için … Üniversitesi … Etik Kurulu’nun … tarih ve … sayılı kararı ile izin alınmıştır.”). İzin gerektirmeyen çalışmalarda “Bu çalışma etik kurul izni gerektirmemektedir.” ifadesi kullanılır. İnsan veya hayvan denekler, anket ve mülakat içeren çalışmalarda etik kurul izni zorunludur.

ÇIKAR ÇATIŞMASI: Yazarların çalışmayla ilgili herhangi bir çıkar çatışması bulunup bulunmadığı belirtilmelidir (örn. “Yazarlar arasında çıkar çatışması bulunmamaktadır.”). Çıkar çatışması varsa niteliği açıkça yazılmalıdır.

FİNANSAL DESTEK: Çalışmanın desteklenip desteklenmediği, destek varsa destekleyen kurum ve proje numarası belirtilmelidir (örn. “Bu çalışma … tarafından … numaralı proje ile desteklenmiştir.”). Destek alınmamışsa “Bu çalışma herhangi bir kurumdan finansal destek almamıştır.” ifadesi kullanılır.

Yapay zekâ araçlarının kullanımına ilişkin ilkeler derginin Yayın Etiği sayfasında yer almaktadır; yazarların bu ilkelere uyması beklenir.

9. Şekiller ve Çizelgeler

Şekil, grafik, fotoğraf vb. unsurlar “Şekil”; sayısal değer içeren unsurlar “Çizelge” olarak adlandırılmalı ve metin içinde atıfta bulunulmalıdır. Açıklamalar Şekillerin altında, Çizelgelerin üstünde verilmelidir. Şekil ve Çizelgeler mümkün olduğunca birleştirilerek/özetlenerek metin içinde uygun yerlere yerleştirilmelidir (Kaynaklar bölümünden sonra verilmemelidir).

Ortalamalar arasındaki farklılığın önemine ilişkin test ve anlamlılık düzeyi Çizelgenin altında belirtilmelidir. Çizelgelerde dipnotlar alfabenin son harfinden başlanarak verilmelidir. Şekiller baskı tekniği gereği Microsoft Office programlarında hazırlanmalıdır. Fotoğraflar baskıya uygun olmalıdır.

Çizelge 1. 2001 yılında Çanakkale yöresinde yetiştirilen Trabzon hurması meyvelerinin olgunlaşma sürecinde kimyasal yapılarındaki değişimler

	MES (kg)	SÇKM (%)	L-askorbik asit (mg·100 g⁻¹)	Tanen (mg·100 g⁻¹)	Pektin (mg·100 g⁻¹)	Toplam şeker (mg·100 g⁻¹)
1. Hasat	4,30 b	23,84 a	21,85 ab	20,59 a	1,02	22,04 d
2. Hasat	4,61 a	23,65 a	22,69 ab	20,01 a	1,17	26,15 b
3. Hasat	3,74 c	22,65 ab	23,74 a	17,45 b	1,26	27,90 a
4. Hasat	3,51 c	22,75 ab	20,14 b	17,22 b	1,46	23,74 c
5. Hasat	3,38 c	22,46 b	7,89 c	16,90 b	1,19	23,93 c
LSD	0,28	0,37	2,00	0,89	Ö.D.	1,46

Aynı sütunda farklı harflerle ifade edilen ortalamalar arasında %5 düzeyinde farklılık vardır (LSD)

Ö.D.: Önemli değil

📎 Şekil 1 [tr].png

Şekil 1. Boğma (girdling) uygulamasının bitki boyu (cm) üzerine etkisi

10. Birimler

Makalelerde SI (Système International d’Unités) ölçü birimleri kullanılmalıdır. Birimlerde “/” yerine üstel ifade kullanılmalıdır; birim çarpımlarında orta nokta (·) kullanılır ve litre simgesi büyük L ile yazılır (örn. mg/l yerine mg·L⁻¹, mg/kg yerine mg·kg⁻¹).

11. Kaynaklar (APA 7)

BAHÇE dergisi, tüm makalelerde referans listesinin hazırlanmasında APA 7. sürüm formatını kullanır. Metin içi atıflar ve kaynak gösterimi APA 7 kurallarına göre yapılmalıdır; örnekler aşağıda verilmiştir.

Metin içi atıf:
- Tek yazar: (Soyad, Yıl) → (Özbek, 1969)
- İki yazar: (Soyad & Soyad, Yıl) → (Kaşka & Yılmaz, 1974)
- Üç ve daha fazla yazar: (Soyad et al., Yıl) → (Büyükyılmaz et al., 1994)
Liste düzeni:
- Yazarlar alfabetik sıraya göre listelenir.
- İkinci ve sonraki satırlar hanging indent (1 cm içeride).
- Tüm kaynaklar APA 7’ye uygun formatta yazılır.

Örnekler:

Kitap:

Özbek, N. (1969). Deneme tekniği (I. Sera denemesi, tekniği ve metotları). Ankara: Ankara Üniversitesi Basımevi.

Kitap bölümü:

Brown, A. C. (1975). Apples. In J. Janick & J. N. Moore (Eds.), Advances in fruit breeding (pp. 3–37). West Lafayette, IN: Purdue University Press.

Çeviri:

Kaşka, N., & Yılmaz, M. (1974). Bahçe bitkileri yetiştirme tekniği [Horticultural cultivation technique] (Translation: H. T. Hartman & D. E. Kester). Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi, Yayınlar, 79, 610 s.

Makale/Bildiri:

Büyükyılmaz, M., Bulagay, A. N., & Burak, M. (1994). Marmara bölgesi için ümitvar armut çeşitleri–III. Bahçe, 23(1–2), 79–92.

Turhan, Ş., Tipi, T., & Erol, A. O. (2004). EurepGap uygulamalarının Türk yaş meyve–sebze üretimi ve rekabet gücü üzerine etkileri. Türkiye VI. Tarım Ekonomisi Kongresi, 1, 315–322.

Tez:

Akpınar, I. (1990). Değişik turunçgil anaçları üzerine aşılı Washington Navel, Valencia ve Moro portakal meyvelerinin muhafazası üzerine araştırmalar (Yüksek Lisans Tezi). Çukurova Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı, Adana, Türkiye.

Süreli Yayın / Kurumsal Yayın:

Anonymous. (1951). Soil survey manual handbook. Washington, D.C.: U.S. Government Printing Office.

Anonim. (2000). Tarımsal yapı (üretim, fiyat, değer) (Yayın No: 2614). Ankara: T.C. Başbakanlık Devlet İstatistik Enstitüsü.

Elektronik Kaynaklar:

Stiglitz, J. E. (1999). Whither reform? Ten years of the transition. Annual World Bank Conference on Development Economics, Washington, D.C., 28–30 April. https://www.worldbank.org/research/abcde/stiglitz.html

12. Word Stillerinin Kullanımı

Makale Şablonu'ndaki tüm biçimlendirmeler (başlıklar, yazar/kurum bilgileri, öz, çizelge ve şekil başlıkları, kaynakça vb.) hazır Word stilleri olarak tanımlanmıştır. Makalenizi hazırlarken, ilgili öğeyi yazdıktan sonra Word'ün Giriş sekmesindeki Stiller panelinden uygun stili seçmeniz yeterlidir.

Elle biçimlendirme (kalın, italik, büyük harf, punto değiştirme, satır boşluğu veya girinti ayarlama gibi) yapmak yerine her zaman şablondaki hazır stilleri kullanınız. Bu kural metnin her bölümü için geçerlidir; yalnızca başlıklar için değil, yazar/kurum bilgileri, öz, anahtar kelimeler, çizelge ve şekil başlıkları ile kaynakça için de aynı şekilde uygulanmalıdır.

Stillerin tutarlı kullanılması, makalenizin mizanpaj ekibi tarafından hızlı ve hatasız şekilde işlenmesini sağlar; elle yapılan biçimlendirmeler ise mizanpaj sürecinde fark edilmesi güç hatalara ve gecikmelere yol açabilir.

Not: Stillerin görsel tanımını (yazı tipi, punto, renk vb.) değiştirmek mizanpaj ekibinin sorumluluğundadır; yazarların stil tanımlarını değiştirmemesi, yalnızca doğru stili seçmesi beklenir.