Manisa Yöresinde Beta-Talasemi Mutasyon Dağılımı

Abstract

Giriş ve Amaç: Beta (β)-talasemi, Türkiye’deki en yaygın genetik bozukluklardan biridir. Bu çalışmanın amacı Manisa ili ve çevresindeki β-talasemi mutasyonlarının tipini ve dağılımını tespit etmek, Manisa'nın Türkiye β-talasemi mutasyon haritasındaki yerini belirlemektir. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışma; Etik Kurul onayı alındıktan sonra Celal Bayar Üniversitesi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Çocuk Hematoloji Bilim Dalı’ nda prospektif olarak gerçekleştirildi. Çalışmaya, β-talasemi major ve β-talasemi taşıyıcılığı tanısıyla takip edilen 85 hasta alındı. β-talasemi taşıyıcılarında çalışmaya dahil edilme kriteri olarak HbA2 düzeyinin % 3.5’in üzerinde olması dikkate alındı. Beta Globin Strip Assay yöntemi ile beta globin geninde sıklıkla görülen ve Akdeniz ülkelerine özgü 22 mutasyon tarandı. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 85 hastanın 15’inde, taranan 22 mutasyondan hiç birinde pozitiflik saptanmadı. Kalan 70 hastanın 2 tanesinin birleşik heterozigot formunda (%2.8), 1 hastanın homozigot formunda (1.4), 67 hastanın da heterozigot formunda (%95.8) mutant allel taşıdığı tespit edildi. En yaygın görülen β-talasemi mutasyonu, Türkiye genelinde olduğu gibi IVS1-110 (% 35.3) olarak bulundu. Bunu sırasıyla IVS2-1 (%14.1), codon 39 (%8.2), IVS2-745 (%7.1), IVS1-6 (%5.9), IVS1-1 (%3.5), codon 5 (%2.4), codon 8 (%3.5), codon 44 (%2.4), -87 (%1.2), codon 36/37 (%1.2) mutasyonları takip etti. -30, HbC, HbS, codon 6, codon 8/9, codon 22, codon 30, IVS1-2, IVS1-5, IVS1-116, IVS1-25, codon 44 mutasyonları hiçbir hastamızda tespit edilmedi. Sonuç: Çalışmamızda beta globin strip assay testinin sensivitesi % 82.3 oranında bulundu. Beta-Talasemi mutasyonları açısından Türkiye’deki genel ortalamanın Manisa’da da değişmediği, IVS1-110 mutasyon tipinin Manisa’da da en sık mutasyon olduğu bulundu. Manisa ilinde talasemi taşıyıcılığının % 4.5 gibi yüksek bir oranda bulunmasının yanı sıra en çok göç alan iller arasında yer alan ilimizde akraba evliliğinin fazla görülmesinden dolayı prenatal tanı merkezlerinin arttırılması ve bir halk sağlığı sorunu olan bu konu üzerinde aktif olarak çalışılması gerektiğini düşünmekteyiz.

Keywords

• beta talasemi
• mutasyon
• Manisa

Distribution of Beta-Thalassemia Mutation in Manisa Region

Abstract

Objective: Beta (β) – thalassemia is one of the most common inherited genetic disorders in Turkey. The purpose of this study was to determine the type and distribution of β-thalassemia mutations in Manisa province and around of it and to determine the location of Manisa in the β-thalassemia mutations map of Turkey. Materials and Methods: This study was carried out prospectively in Celal Bayar University Faculty of Medicine, Division of Pediatric Hematology, after the approval of the Ethics Committee. Eighty-five patients with a diagnosis of β-thalassemia major and β-thalassemia carrier were included in the study. HbA2 level above 3.5% was taken into account as inclusion criteria in β-thalassemia carriers. Results: 22 mutations frequently seen in the beta globin gene and specific to Mediterranean countries were screened with the Beta Globin Strip Assay method. No positivity of the 22 mutations screened were found in 15 of the 85 patients included in the study. It was determined that 2 of the remaining 70 patients carried the mutant allele in the combined heterozygous form (2.8%), 1 patient in the homozygous form (1.4), and 67 patients in the heterozygous form (95.8%). The most common β-thalassemia mutation overall was found IVS1-110 (35.3%), as in Turkey. This was followed by mutations of IVS2-1 (14.1%), codon 39 (8.2%), IVS2-745 (7.1%), IVS1-6 (5.9%), IVS1-1 (3.5%), codon 5 (2.4%), codon 8 (3.5%), codon 44 (2.4%), -87 (1.2%), codon 36/37 (1.2%), respectively. Mutations of -30, HbC, HbS, codon 6, codon 8/9, codon 22, codon 30, IVS1-2, IVS1-5, IVS1-116, IVS1-25, codon 44 were not detected in any of the patients. Conclusion: In our study, the sensitivity of beta globin strip assay test was found to be 82.3%. Beta-thalassemia mutations weren’t changed in terms of the overall average in Manisa in Turkey and IVS1-110 was found to be the most common type of mutation in Manisa. We think that prenatal diagnosis centers actively working on this issue should be increased in number as β-thalassemia is a big public health problem due to the high rate of 4.5% of consanguineous marriage in Manisa province as it is one of the most immigrant attending provinces, as well as the high rate of thalassemia carriage.

Keywords

• beta thalassemia
• mutation
• Manisa

References

1. Weatherall, D.J, Clegg J.B, et al., The clinical and molecular heterogeneity of the thalassemia syndromes, Annals of the New York Academy of Sciences, 1980, 344, 83-100.
2. Origa Rn, β-Thalassemia, Genetics in medicine: official journal of the America College of Medical Genetics, 2017, 19(6), 609-619.
3. Arcasoy A, Çavdar A, ve ark., Türkiye’de thalassemia ve anormal hemoglobin insidansı, Ankara: Nuray Matbası, 1978, 19-26.
4. Canatan D, Dünyada ve Türkiye’de talasemi ve anormal hemoglobinler, Türk Hematoloji Derneği 5. Ulusal Talasemi Gençlik Kampı, 2004, İzmir, Türkiye.
5. TÜİK, Adrese Dayalı Nüfus Kayıt Sistemine göre Düzey 1 bölgelerinin (12 bölge) aldığı göç, verdiği göç, net göç ve net göç hızı, Türkiye İstatistik Kurumu, 2009.
6. Tadmouri G.O, Tüzmen Ş, ve ark., Molecular and population genetic analyses of beta-thalassemia in Turkey, American journal of hematology, 1998, 57(3), 215-20.
7. Tadmouri G.O, Başak A.N, Beta-thalassemia in Turkey: a review of the clinical, epidemiological, molecular, and evolutionary aspects, Hemoglobin, 2001, 25(2), 227-39.
8. Ugozzoli, L.A, Lowery J.D, et al., Evaluation of the BeTtha gene 1 kit for the qualitative detection of the eight most common Mediterranean beta-thalassemia mutations, American journal of hematology, 1998, 59(3), 214-22.