Galleria mellanolla’nın enzimatik savunma sistemi elemanları, glutatyon peroksidaz (GPx) ve glutatyon-S-transferaz (GST) enzimleri üzerine oktadekanoik asit, oleik asit ve n-hekzadekanoik asitin etkilerinin in silico gösterilmesi
Öz
Galleria mellonella, büyük bal mumu güvesi olarak da bilinir ve arı kovanlarında peteklerin üzerinde gal yaparak verimin düşmesine yol açar. Hem zararlı olması hem de model böcek olarak kullanılması laboratuvar çalışmalarında tercih edilmesini sağlamıştır. Günümüzde, üretimde verimin düşmesine yol açan zararlı böceklerle mücadelede kimyasal mücadelenin olumsuz etkilerini ortadan kaldıracak alternatif yöntemlerin kullanılma gerekliliği bilinen bir gerçektir. Bu yöntemlerden biri de bitkisel kaynaklı ürünlerdir. Bitkiler çok çeşitli organik bileşikler üretmektedir ve bu bileşikler onların çeşitli hastalık ve zararlılara karşı dayanıklı olmasında rol oynayabilmektedir. Bu çalışmada Aronia melanocarpa bitkisinin yaprak özütü içeriğinde en fazla miktarda bulunan üç maddenin (oktadekanoik asit, oleik asit, n-hekzadekanoik asit) G. mellonella’nın enzimatik savunma sistemi elemanlarından olan glutatyon peroksidaz (GPx) ve glutatyon-S-transferaz (GST) enzimleri üzerine etkileri moleküler kenetleme ile in silico olarak gösterilmiştir. Kenetlenme sonuçları, Autodock Vina, VMD ve Maestro programları kullanılarak elde edilmiştir. En yüksek bağlanma değeri, protein ve ligand arasındaki sıkı bağlanmayı temsil eder. Çalışmamızda en yüksek bağlanma değeri, GPx enzimi ile oktadekanoik asit molekülü arasında elde edilirken (-7.2 kcal/mol) en düşük bağlanma değeri GPx enzimi ile n-hekzadekanoik asit arasında gerçekleşmiştir (-3.8 kcal/mol). GST enzimi ile üç madde arasında oktadekanoik asit molekülü en yüksek bağlanmayı göstermiştir (-5.7 kcal/mol).
Anahtar Kelimeler
Galleria mellonella, GPx, GST, moleküler kenetlenme
Destekleyen Kurum
TUBİTAK 2209-A Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı
Teşekkür
Bu çalışma TUBİTAK 2209-A Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı kapsamında desteklenmiştir. Teşekkürü bir borç biliriz.
Kaynakça
- Angioni A, Barra A, Coronco V, Dessi S, Cabras P (2006). Chemical composition, seasonal variability and antifungal activity of Lavandula stoechas L. ssp. stoechas essential oils from stem/leaves and flowers. Journal of Agricultural and Food Chemistry 54: 4364-4370.
- Aysan Ö, Dede B (2020). Bazı Oksim Bileşiklerinin Bağlanma Özelliklerinin Moleküler Kenetlenme Yöntemiyle İncelenmesi. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi Cilt 24, Sayı 2, 333-339.
- Ayvaz A, Karaborklu S, Sagdıc O (2009). Fumigant toxicity of five essential oils against the eggs of Ephestia kuehniella Zeller and Plodia interpunctella (Hübner) (Lepidoptera: Pyralidae). Asian Journal of Chemistry 21:596-604.
- Bachrouch O, Jemaa J M B, Chaieb I, Talou T, Marzouk B (2010). Insecticidal activity of Pistacia lentiscus essential oil on Tribolium castaneum (Coleoptera: Tenebrionidae) as alternative to chemical control in storage. Tunisian Journal of Plant Protection 5: 63–70.
- Ercan F S, Baş H, Koç M, Pandır D, Öztemiz S (2013). Insecticidal activity of essential oil of Prangos ferulacea (Umbelliferae) against Ephestia kuehniella (Lepidoptera: Pyralidae) and Trichogramma embryophagum (Hymenoptera: Trichogrammatidae). Turkish Journal of Agriculture and Forestry 37: 719-725.
- Ercan F, Bas H, Ercan N, Vural C, Özcan S (2018). Fumigant Toxicitiy of Essential Oils from Thymus argaeus Boissier & Balansa and Thymus sipyleus Boissier(Lamiaceae) Againts Ephestia kuehniella Zeller (Lepidoptera: Pyralidae). International Journal of Scientific and Technological Research 4(3), 54-60.
- Humphrey W, Dalke A, Schulten K (1996.) ``VMD-Visual Molecular Dynamics'' Journal of Molecular Graphics 14.1, 33-38.
- Jurikova T, Mlcek J, Skrovankova S, Sumczynski D, Sochor J, Hlavacova I, Snopek L, Orsavova J (2017). Fruits of black chokeberry Aronia melanocarpa in the prevention of chronic diseases. Molecules 22(6), 1–23.
- Kelley L A, Mezulis S, Yates C M, Wass M N, Sternberg M J E (2015). The Phyre2 web portal for protein modeling, prediction and analysis. Nature Protocols 10(6): 845-58.
- Oszmiański J, Lachowicz S (2016). Effect of the production of dried fruits and juicefrom chokeberry (Aronia melanocarpa L.) on the content and antioxidative activity of bioactive compounds. Molecules 21, 1098.