Evaluation of Hepatitis C virus genotype and viral loads in patients with chronic Hepatitis C infection: A five-year, single-center retrospective study

Öz

Aim: HCV genotypes differ in the prognosis and treatment of chronic hepatitis caused by hepatitis C virüs. In this study; It was aimed to evaluate the HCV genotype and HCV-RNA values of the patients followed up with the diagnosis of chronic HCV infection in Mersin City Training and Research Hospital, Department of Infectious Diseases and Clinical Microbiology. Method: Age, gender, HCV-RNA and genotype data of 202 adult patients who were followed up with the diagnosis of chronic HCV infection in the Infectious Diseases and Clinical Microbiology Clinic of Mersin City Training and Research Hospital between February 2017 and February 2022 were evaluated retrospectively through patient files and hospital information system. HCV-RNA values were determined with Bosphore Ultra HCV Quantification Detection Kit and HCV genotypes were determined with Bosphore HCV Genotyping Kit v3. Results: Of the 202 patients followed up with chronic HCV infection in a five-year period, 60 (29.7%) were female and 142 (70.3%) were male. The mean age was 44.6±18.3 years. Of the patients, 65 (32.1%) were genotype 1b, 53 (26.2%) genotype 1a, 41 (20.3%) genotype 3, 24 (11.9%) genotype 4, 11 (5.4%) genotype 2, 2 (1%) genotype 5, 2 (1%) genotype 3-4, 2 (1%) genotype 1b-4, 1 (0.5%) genotype 2-3, 1 (0.5%) genotype 3-4 association was detected. Genotype 4 was significantly higher in 25 (12.4%) foreign nationals (p<0.001). The median HCV-RNA was 167,650 IU/ml (range: 105-19,526,197 IU/ml). There was no significant relationship between genotypes in terms of HCV-RNA levels. Genotype 1b was significantly higher in females (p<0.05). The mean age of patients with genotype 1 was significantly higher than the other genotypes (48.5 years/39.4 years, p=0.003). Conclusion: Due to the increase in the foreign national patient population in our region in recent years, it is noteworthy that the genotypes and mixed type HCV infections that are less common in our region are increasing. Determination of HCV genotypes is thought to be important in terms of guiding the course and treatment of chronic HCV infections and showing the changes in HCV epidemiology in the region.

Anahtar Kelimeler

• Chronic hepatitis C virus (HCV) infection
• HCV genotype
• HCV viral load

Kronik Hepatit C enfeksiyonu olan hastaların Hepatit C virüs genotip ve viral yüklerinin değerlendirilmesi: Beş yıllık tek merkezli retrospektif çalışma

Öz

Amaç: Hepatit C virüsü nedenli kronik hepatitlerin prognozunda ve tedavisinde HCV genotipleri farklılık göstermektedir. Bu çalışmada; Mersin Şehir Eğitim ve Araştırma Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Bölümü’nde, kronik HCV enfeksiyonu tanısı ile takip edilen hastaların HCV genotip ve HCV-RNA değerlerinin değerlendirilmesi amaçlandı. Yöntem: Şubat 2017- Şubat 2022 tarihleri arasında Mersin Şehir Eğitim ve Araştırma Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Bölümü’nde kronik HCV enfeksiyonu tanısı ile takip edilen erişkin 202 hastanın yaş, cinsiyet, HCV-RNA ve genotip verileri hasta dosyaları ve hastane bilgi sistemi aracılığıyla retrospektif olarak değerlendirildi. HCV-RNA değerleri Bosphore Ultra HCV Quantification Detection Kiti ile HCV genotipleri Bosphore HCV Genotyping Kit v3 ile tespit edildi. Bulgular: Beş yıllık dönemde kronik HCV enfeksiyonu tanısı ile takip edilen erişkin 202 hastanın 60’ı (%29.7) kadın, 142’si (%70.3) erkekti. Yaş ortalaması 44.6±18.3 yıldı. Hastaların 65’inde (%32.1) genotip 1b, 53’ünde (%26.2) genotip 1a, 41’inde (%20.3) genotip 3, 24’ünde (%11.9) genotip 4, 11’inde (%5.4) genotip 2, 2’sinde (%1) genotip 5, 2’sinde (%1) genotip 3-4, 2’sinde (%1) genotip 1b-4, 1’inde (%0.5) genotip 2-3, 1’inde (%0.5) genotip 3-4 birlikteliği tespit edildi. 25 (%12.4) yabancı uyruklu hastada genotip 4 anlamlı derecede daha fazla tespit edildi (p<0.001). Ortanca HCV-RNA değeri 167.650 IU/ml (aralık: 105-19.526.197 IU/ml)’ydi. Genotipler arasında HCV-RNA düzeyleri açısından anlamlı bir ilişki saptanmadı. Kadınlarda genotip 1b anlamlı olarak daha fazla saptandı (p<0.05). Genotip 1’i olan hastaların yaş ortalaması diğer genotiplere göre daha yüksekti (48.5 yıl/39.4 yıl, p=0.003). Sonuç: Bölgemizde yabancı uyruklu hasta popülasyonunun son yıllarda artması nedeniyle, bölgemizde daha az görülen genotipler ve mikst tip HCV enfeksiyonlarında artış olması dikkat çekmektedir. HCV genotiplerinin belirlenmesinin, kronik HCV enfeksiyonlarının seyrinde ve tedavisinde yol göstermesi ayrıca bölgedeki HCV epidemiyolojisindeki değişiklikleri göstermesi açısından önemli olduğu düşünülmektedir.

Anahtar Kelimeler

• Kronik hepatit C (HCV) enfeksiyonu
• HCV genotip
• HCV viral yük

Destekleyen Kurum

Yok

Kaynakça

1. Guntipalli P, Pakala R, Kumari Gara S, et al. Worldwide prevalence, genotype distribution and management of hepatitis C. Acta Gastroenterol Belg. 2021;84(4):637-56.
2. World Health Organization. WHO Hepatitis C. https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/hepatitis-c. 19 Eylül 2022 tarihinde erişildi.
3. Tezcan S, Ulger M, Aslan G, et al. Determination of hepatitis C virus genotype distribution in Mersin province, Turkey. Mikrobiyol Bul. 2013;47(2):332-8.
4. Akıncı E, Kayaaslan BÜ, Başbuğ AT, Eren SS, Öngürü P, Bodur H. Evaluation of Sustained Virological Response in Patients with Genotype 1b Chronic Hepatitis C Infection. Viral Hepat J. 2013;19(2):80-4.
5. Cebeci İ, Tanoglu A, Şahiner F, et al. Kronik hepatit C hastalarında antiviral tedaviye yanıtta etkili olabilecek parametrelerin değerlendirilmesi. Gülhane Tıp Derg. 2015;57:373-7.
6. Tran TT. A review of standard and newer treatment strategies in hepatitis C. Am J Manag Care. 2012;18(14 Suppl):340-9.
7. Martinez MA, Franco S. Therapy implications of hepatitis C virus genetic diversity. Viruses. 2020;13(1):41.
8. Polaris Observatory HCV Collaborators. Global prevalence and genotype distribution of hepatitis C virus infection in 2015: a modelling study. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2017;2(3):161-176.

9. Shah R, Ahovegbe L, Niebel M, Shepherd J, Thomson EC. Non-epidemic HCV genotypes in low- and middle-income countries and the risk of resistance to current direct-acting antiviral regimens. J Hepatol. 2021;75(2):462-473.
10. Petruzziello A, Marigliano S, Loquercio G, Cacciapuoti C. Hepatitis C virus (HCV) genotypes distribution: an epidemiological up-date in Europe. Infect Agent Cancer. 2016;11: 53.
11. Kalayci R, Altindiş M, Gülamber G, Demirtürk N, Akcan Y, Demirdal T. Genotype distribution of chronic hepatitis B and hepatitis C patients and investigation of the resistance patterns in hepatitis B cases. Mikrobiyol Bul. 2010;44(2):237-43.
12. Ural O, Arslan U, Fındık D. Konya Bölgesinde Hepatit C Virusu Genotip Dağılımı. İnfeksiyon Dergisi. 2007;21(4):175-81.
13. Buruk CK, Bayramoğlu G, Reis A, Kaklıkkaya N, Tosun I, Aydın F. Determination of hepatitis C virus genotypes among hepatitis C patients in Eastern Black Sea Region, Turkey. Mikrobiyol Bul. 2013;47(4):650-7.
14. Sari ND, Karataş A, İncı A, Yörük G. Yerli ve Yabancı Hastalarda Hepatit C Virüs Genotip Dağılımının Değerlendirilmesi. Türkiye Klinikleri Tıp Bilimleri Dergisi. 2020;40(2):148-53.
15. Genç S, Uğur M, Karagöz E, Avcı Çiçek E. Giresun İli Hepatit C Hastalarında Genotip Dağılımının Araştırılması. FLORA. 2020;25(4), 549-554.
16. Alacam S, Bakir A, Karatas A. Hepatitis C virus genotypes and viremia in a tertiary hospital in Istanbul, Turkey. J Infect Dev Ctries. 2022;16(4):668-674.
17. Çetin Duran A, Kaya Çetinkaya Ö, Sayıner AA, Şeydaoğlu G, Özkarataş E, Abacıoğlu H. Changes on Hepatitis C virus genotype distribution in Western Turkey: Evaluation of twelve-year data. Turk J Gastroenterol. 2020;31(2):128-135.
18. Sağlık İ, Mutlu D, Öngut G, et al. Distribution of hepatitis C virus genotypes among patients with chronic hepatitis C infection in Akdeniz University Hospital, Antalya, Turkey: a five-year evaluation. Mikrobiyol Bul. 2014;48(3):429-37.
19. Kirişçi Ö, Çalışkan A, Koçtürk SA, Erdoğmuş P, Gül M. Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte Bireylerde Genotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. Viral Hepatit Derg. 2013;19(2):67-70.
20. Suntur BM, Kaya H, Eker HBŞ, Kara B, Bozok T, Unal N. A cross-sectional study of real life data of HCV from Turkey south region. J Infect Dev Ctries. 2020;14(4):380-6.
21. Kuşcu F, Kömür S, İnal AS. Changing epidemiology of chronic hepatitis C in Adana. Viral Hepat J. 2014;20(1):15-8.
22. Karabulut N, Alacam S, Yolcu A, Onel M, Agacfidan A. Distribution of hepatitis C virus genotypes in Istanbul, Turkey. Indian J Med Microbiol. 2018;36(2):192-6.
23. Bulut ME, Topalca US, Murat A, et al. HCV Genotype Distribution of Patients with Chronic Hepatitis C in Istanbul. Sisli Etfal Hastan Tip Bul. 2021;55(1):86-92.
24. Selek MB, Baylan O, Karagöz E, Özyurt M. Changes in hepatitis C virus genotype distribution in chronic hepatitis C infection patients. Indian J Med Microbiol. 2018;36(3):416-421.
25. Çizmeci Z. Kronik Hepatit C Enfeksiyonlu Hastalarda Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2016;46(1):27-32.
26. Kırdar S, Yaşa MH, Aydın N, Korkmaz Gültekin B, Öztürk ŞB, Kurt Ömürlü İ. Kronik hepatit C enfeksiyonlu hastalarda hepatit C virüsü genotiplerinin dağılımı. Meandros Med Dent J. 2015;16:108-13.
27. Balın ŞÖ, Tartar AS, Akbulut A, Toraman ZA. Elazığ İlinde Hepatit C Virüs Genotip Dağılımı ve Genotipin HCV RNA ve Serum Alanin Aminotransferaz Düzeyleri ile İlişkisi. Ankem Derg. 2017;31(2):48-52