Araştırma Makalesi

HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı

Cilt: 21 Sayı: 4 29 Aralık 2020
PDF İndir
EN TR

HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı

Öz

Heterobasidion annosum Fr. Bref. sensu lato, Kuzey Yarım kürenin ılıman kuşakta yer alan ülkelerinde, özellikle ibreli ağaç türlerinde kök ve kök boğazı çürüklüğüne neden olan oldukça tahripkâr bir hastalık etmenidir. Heterobasidion türlerinin mücadelesinde, fungusun konukçusu olmayan ağaç türlerinin seçimi, kimyasal maddeler ve biyolojik kontrol etmenleri kullanılmaktadır. Ancak, bu kontrol yöntemlerinin hiçbiri patojene karşı tam koruma sağlamamaktadır. Bu bağlamda, hastalık etmeni ile mücadele yöntemlerinin geliştirilmesinde sürdürülebilir alternatif metotların araştırılması, önem arz etmektedir. Heterobasidion türleri de dahil olmak üzere birçok fungal türün, çok sayıda farklı mikovirüs topluluğunu barındırdığı bilinmektedir. Bu mikovirüsler, patojen fungusların neden olduğu kayıpları en aza indirerek hastalığı kontrol altına alabilmek üzere biyokontrol ajanı olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada, mikovirüs aktarımı ile, annosum kök ve alt gövde çürüklüğüne karşı mücadele olanaklarının araştırılması amaçlanmıştır. Denemelerde HetPV3-an1 ve HetRV6-ab6 virüsü ile enfekte iki donör izolat ile virüs içermeyen 5 adet H. annosum sensu str., 20 adet H. abietinum izolatı kullanılmıştır. Her iki grupta yer alan izolatlar %2 malt extract agar bulunan Petri kaplarına karşılıklı olarak ekilmiş ve 20°C’de 3 ay süre ile inkübe edilmiştir. İnkübasyon süresi sonunda, gelişmekte olan hiflerin uç kısmından ve koloniler arasındaki birleşim noktasından alınan hifler, Malt- Orange Serum Agar ortamına aktarılmıştır. Alıcı izolatlara potansiyel dsRNA aktarımının gerçekleşip gerçekleşmediği, spesifik primerler ile RT-PCR metodu kullanılarak belirlenmiştir. Denemeler sonunda, test edilen H. abietinum izolatlarının % 15’ si, H. annosum izolatlarının ise % 20’si dsRNA partikülü başarılı bir şekilde aktarılmış ve RT-PCR ile tek segmentli virüs varlığı kesinleştirilmiştir. Bu sonuçlardan yola çıkılarak, mikrovirüs aktarımı yüzdesinin düşük de olsa başarılı olduğu ve gelecekte in vivo çalışmalarla biyokontrol ajanı olarak kullanılabileceği düşünülmektedir.

Anahtar Kelimeler

Destekleyen Kurum

TÜBİTAK TOVAG, LUKE Ormancılık Araştırma Enstitüsü

Teşekkür

Finlandiya LUKE Ormancılık Araştırma Enstitüsünde çalışan Dr. Eeva Vainio’ya donör izolatları gönderdiği için çok teşekkür ederiz. Ayrıca bu projede kullanılan Heterobasidion izolatları TÜBİTAK TOVAG 104O560 no’lu proje kapsamında elde edilmiştir.

Kaynakça

  1. Akıllı, S., Ulubaş-Serçe, Ç., Katırcıoğlu, Y.Z., Maden, S., Rigling, D., 2012. Characterization of hypovirulent isolates of the chestnut blight fungus, Cryphonectria parasitica from the Marmara and Black Sea regions of Turkey. European Journal of Plant Pathology, 135(2): 323-334.
  2. Buck, K.W., 1986. Fungal Virology – An Overview. In: Fungal Virology (Ed: Buck, K.W.), CRC Press, Boca Raton, FL, pp. 1-84.
  3. Coenen, A., Kevei, F., Hoekstra, R.F., 1997. Factors affecting the spread of doublestranded RNA viruses in Aspergillus nidulans. Genetical Research, 69: 1-10.
  4. Cole, T.E., Hong, Y., Brasier, C.M., Buck, K.W., 2000. Detection of an RNA-dependent RNA polymerase in mitochondria from a mitovirus-infected isolate of the Dutch elm disease fungus, Ophiostoma novo-ulmi. Virology, 268: 239-243.
  5. Doğmuş Lehtijärvi, H.T., Lehtijärvi, A., Korhonen, K., 2006. Heterobasidion abietinum on Abies species in western Turkey. Forest Pathology, 36: 280-286.
  6. Doğmuş Lehtijärvi, H.T., Lehtijärvi, A., Korhonen, K., 2007. Heterobasidion on Abies nordmanniana in northeastern Turkey. Forest Pathology, 37: 387-390.
  7. Elliston, J.E., 1982. Hypovirulence. Advanced Plant Pathology, 1: 1-33.
  8. Ghabrial, S.A., 1994. New developments in fungal virology. Advanced Virus Research, 43: 303-388.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yayımlanma Tarihi

29 Aralık 2020

Gönderilme Tarihi

3 Ağustos 2020

Kabul Tarihi

31 Ekim 2020

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2020 Cilt: 21 Sayı: 4

Kaynak Göster

APA
Aday Kaya, A. G., & Doğmuş, T. (2020). HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı. Turkish Journal of Forestry, 21(4), 383-387. https://doi.org/10.18182/tjf.776718
AMA
1.Aday Kaya AG, Doğmuş T. HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı. Turkish Journal of Forestry. 2020;21(4):383-387. doi:10.18182/tjf.776718
Chicago
Aday Kaya, Ayse Gülden, ve Tuğba Doğmuş. 2020. “HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı”. Turkish Journal of Forestry 21 (4): 383-87. https://doi.org/10.18182/tjf.776718.
EndNote
Aday Kaya AG, Doğmuş T (01 Aralık 2020) HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı. Turkish Journal of Forestry 21 4 383–387.
IEEE
[1]A. G. Aday Kaya ve T. Doğmuş, “HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı”, Turkish Journal of Forestry, c. 21, sy 4, ss. 383–387, Ara. 2020, doi: 10.18182/tjf.776718.
ISNAD
Aday Kaya, Ayse Gülden - Doğmuş, Tuğba. “HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı”. Turkish Journal of Forestry 21/4 (01 Aralık 2020): 383-387. https://doi.org/10.18182/tjf.776718.
JAMA
1.Aday Kaya AG, Doğmuş T. HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı. Turkish Journal of Forestry. 2020;21:383–387.
MLA
Aday Kaya, Ayse Gülden, ve Tuğba Doğmuş. “HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı”. Turkish Journal of Forestry, c. 21, sy 4, Aralık 2020, ss. 383-7, doi:10.18182/tjf.776718.
Vancouver
1.Ayse Gülden Aday Kaya, Tuğba Doğmuş. HetRV6 ve HetPV13 mikovirüslerinin Heterobasidion abietinum ve Heterobasidion annosum izolatlarına aktarımı. Turkish Journal of Forestry. 01 Aralık 2020;21(4):383-7. doi:10.18182/tjf.776718