Araştırma Makalesi

Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri

Cilt: 27 Sayı: 3 25 Aralık 2022
PDF İndir
EN TR

Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri

Öz

Kısa sürede büyük miktarlarda kültürlenebilmeleri, genetik manipülasyonlara açık olmaları ve ürettikleri enzimlerin hayvansal ve bitkisel enzimlerden daha aktif ve istikrarlı oluşu bakterilerin çok önemli enzim ve ikincil metabolit kaynakları olarak değerlendirilmelerine sebep olmaktadır. Ayrıca ekstraselüler hidrolitik enzimler ve sideroforlar patojen bakteriler için çok önemli virülans faktörleri olarak bilinmektedir. Bu çalışmada, Van ilinde faaliyet gösteren çiftliklerde, gökkuşağı alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) izole edilerek kültüre alınmış dokuz adet bakteri izolatının çeşitli ekstraselüler hidrolitik enzimleri ve siderofor üretme yetenekleri ilk defa araştırılmıştır. Sonuçlar, test edilen izolatlardan dokuzunun proteaz, sekizinin lipaz, beşinin selülaz, ikisinin pektinaz aktivitesine sahip olduğu, ayrıca yedisinin siderofor üretme yeteneğine sahip olduğunu göstermiştir. Amilaz ve ksilinaz aktiviteleri hiçbir izolatta gözlemlenmemiştir. Ayrıca bu izolatlar morfolojik olarak olası üç ana gruba ayrılmış ve her bir izolat, türe özel geliştirilmiş primerler ile moleküler tanımlamaya tabi tutulmuştur. Türe özgü primerler kullanılarak yapılan moleküler tanımlama, bu izolatların balık patojeni Listonella anguillarum, Yersinia ruckeri ve Lactococcus garvieae olduklarını ortaya koymuştur.

Anahtar Kelimeler

Ekstraselüler enzim, Patojen bakteri, Siderofor

Teşekkür

Bu çalışmada pozitif kontrol olarak kullanılan Y. ruckeri kültür izolatları Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi tarafından desteklenen FBA-2018-6895 numaralı projeden, L. garvieae ve L. anguillarum kültür izolatları ise Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi tarafından desteklenen FYL-2019-7463 numaralı projeden kullanılarak gerçekleştirilmiştir.

Kaynakça

  1. Amore, A., Parameswaran, B., Kumar, R., Birolo, L., Vinciguerra, R., Marcolongo, L., Ionata, E., La Cara, F., Pandey, A., & Faraco, V. (2015). Appli¬cation of a new xylanase activity from Bacillus amyloliquefaciens XR44A in brewer’s spent grain saccharification. Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 90, 573-581. doi: 10.1002/jctb.4589
  2. Aoki, T., Park, C. I., Yamashita, H., & Hirono, I. (2000). Species‐specific polymerase chain reaction primers for Lactococcus garvieae. Journal of Fish Diseases, 23, 1-6. doi: 10.1046/j.1365-2761.2000.00207.x
  3. Bairagi, A., Ghosh, K. S., Sen, S. K., & Ray, A. K. (2002). Enzyme producing bacterial flora isolated from fish digestive tracts. Aquaculture International, 10, 109-121. doi: 10.1023/A:1021355406412
  4. Butt, R. L., & Volkoff, H. (2019). Gut Microbiota and Energy Homeostasis in Fish. Frontiers in Endocrinology (Lausanne), 10, 9. doi: 10.3389/fendo.2019.00009
  5. Carrim, A. J. I., Barbosa, E., & Vieira, J. D. G. (2006). Enzymatic activity of endophytic bacterial isolates of Jacaranda decurrens Cham (Carobinha-do-campo). Brazilian Archives of Biology and Technology, 49, 353–359. doi: 10.1590/S1516-89132006000400001
  6. Das, P., Mandal, S., Khan, A., Manna, S. K., & Ghosh, K. (2014). Distribution of extracellular enzyme-producing bacteria in the digestive tracts of 4 brackish water fish species. Turkish Journal of Zoology, 38, 79-88. doi: 10.3906/zoo-1205-3
  7. Dogan, G., & Taskin, B. (2021). Hydrolytic Enzymes Producing Bacterial Endophytes of Some Poaceae Plants. Polish Journal of Microbiology, 70, 297-304. doi:10.33073/pjm-2021-026
  8. Esakkiraj, P., Immanuel, G., Sowmya, S. M., Iyapparaj, P., & Palavesam, A. (2009). Evaluation of protease-producing ability of fish gut isolate Bacillus cereus. Food and Bioprocess Technology, 2. 383-390. doi: 10.1007/s11947-007-0046-6
  9. Fasim, A., More, V. S., & More, S. S. (2021). Large-scale production of enzymes for biotechnology uses. Current Opinion in Biotechnology, 69, 68-76. doi: 10.1016/j.copbio.2020.12.002
  10. Fernández, L., Méndez, J., & Guijarro, J. A. (2007). Molecular virulence mechanisms of the fish pathogen Yersinia ruckeri. Veterinary microbiology, 125, 1-10. doi: 10.1016/j.vetmic.2007.06.013

Kaynak Göster

APA
Taşkın, B., & Önalan, Ş. (2022). Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 27(3), 512-520. https://doi.org/10.53433/yyufbed.1082784
AMA
1.Taşkın B, Önalan Ş. Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri. YYUFBED. 2022;27(3):512-520. doi:10.53433/yyufbed.1082784
Chicago
Taşkın, Bilgin, ve Şükrü Önalan. 2022. “Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri”. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 27 (3): 512-20. https://doi.org/10.53433/yyufbed.1082784.
EndNote
Taşkın B, Önalan Ş (01 Aralık 2022) Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 27 3 512–520.
IEEE
[1]B. Taşkın ve Ş. Önalan, “Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri”, YYUFBED, c. 27, sy 3, ss. 512–520, Ara. 2022, doi: 10.53433/yyufbed.1082784.
ISNAD
Taşkın, Bilgin - Önalan, Şükrü. “Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri”. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 27/3 (01 Aralık 2022): 512-520. https://doi.org/10.53433/yyufbed.1082784.
JAMA
1.Taşkın B, Önalan Ş. Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri. YYUFBED. 2022;27:512–520.
MLA
Taşkın, Bilgin, ve Şükrü Önalan. “Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri”. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, c. 27, sy 3, Aralık 2022, ss. 512-20, doi:10.53433/yyufbed.1082784.
Vancouver
1.Bilgin Taşkın, Şükrü Önalan. Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) İzole Edilen Patojen Bakteri İzolatlarının Hidrolitik Enzim Aktiviteleri ve Siderofor Üretim Yetenekleri. YYUFBED. 01 Aralık 2022;27(3):512-20. doi:10.53433/yyufbed.1082784