Asmada (Vitis vinifera cv. Sultani Çekirdeksiz) Bax İnhibitor-1 Geninin İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu

Cilt: 49 Sayı: 3 1 Eylül 2012
Birsen Çakır
PDF İndir
EN TR

Asmada (Vitis vinifera cv. Sultani Çekirdeksiz) Bax İnhibitor-1 Geninin İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu

Öz

P rogramlanmış hücre ölümü (PCD) canlılarda, gelişmede ve çevresel stres faktörlerinin etkisi ile zarar görmüş hücrelerin elimine edilmesinde önemli bir fizyolojik olaydır. Bax inhibitor-1 (BI-1) proteininin hücre ölümünü engellediği ve ökaryotlarda yüksek oranda korunduğu gösterilmiştir. Bu çalışmada, Vitis vinifera cv. Sultani Çekirdeksiz çeşidinin üzüm tanelerinden gen izole edilmiş ve VvBI-1 olarak adlandırılarak gen bankasına kayıt altına alınmıştır. Olası VvBI-1 geninin protein kodlayan kısmı 747 bç uzunluğundadır ve protein büyüklüğü de 248 aa olarak bulunmuştur. VvBI-1 protein dizisinin 27,290 kDa büyüklüğünde olduğu ve olası izoelektrik noktasının da 8,62 olduğu öngörülmüştür. Farklı gelişme dönemlerinde hasat edilmiş üzüm tanelerinden semi quantitative RT-PCR analizi ile VvBI-1 geninin ifade profili çıkarılmış ve VvBI-1 ifadesinin yüksek oranda ve tüm gelişme dönemlerinde var olduğu gözlemlenmiştir

Anahtar Kelimeler

-

Kaynakça

  1. Bolduc, N., and L. F. Brisson, 2002. Antisense down regulation of NtBI-1 in tobacco BY-2 cells induces accelerated cell death upon carbon starvation. FEBS Letters 532(1–2): 111-114.
  2. Bolduc, N., M. Ouellet, F. Pitre, and L. Brisson, 2003. Molecular characterization of two plant BI-1 homologues which suppress Bax-induced apoptosis in human 293 cells. Planta 216(3): 377- 386.
  3. Bras, M., B. Queenan and S.A. Susin, 2005. Programmed Cell Death via Mitochondria: Different Modes of Dying. Biochemistry (Mosc) 70(2): 231-239.
  4. Datta, R. S., C. Meacham, B. Samad, C. Neyer and K. Sjalander,
  5. Chae, H.-J., N. Ke, H.-R. Kim, S. Chen, A. Godzig, M. Dickman and J.C. Reed, 2003. Evolutionarily conserved cytoprotection provided by Bax Inhibitor-1 homologs from animals, plants, and yeast. Gene 323(0): 101-113.
  6. Coupe, S. A., L. M. Watson, D.J. Ryan, T.T. Pinkley and J.R. Eason, 2004. Molecular analysis of programmed cell death during senescence in Arabidopsis thaliana and Brassica oleracea: cloning broccoli LSD1, Bax inhibitor and serine palmitoyltransferase homologues. Journal of Experimental Botany 55(394): 59-68.
  7. Danon, A., V. Delorme, N. Mailhac and P. Gallois, 2000. Plant programmed cell death: A common way to die. Plant Physiology and Biochemistry 38(9): 647-655. 2009. Berkeley PHOG: PhyloFacts orthology group prediction web server. Nucleic Acids Research 37(suppl 2): W84-W89.
  8. Davies, C. and S.P. Robinson, 1996. Sugar Accumulation in Grape Berries (Cloning of Two Putative Vacuolar Invertase cDNAs and Their Expression in Grapevine Tissues). Plant Physiology 111(1): 275-283.
  9. Eichmann, R., H. Schultheiss, K.H. Kogel and R. Hückelhoven, 2004. The Barley Apoptosis Suppressor Homologue Bax Inhibitor-1 Compromises Nonhost Penetration Resistance of Barley to the Inappropriate Pathogen Blumeria graminis f. sp. tritici. Molecular Plant-Microbe Interactions 17(5): 484-490.
  10. Ellis, H. M. and H. R. Horvitz, 1986. Genetic control of programmed cell death in the nematode C. elegans. Cell 44(6): 817-829.

Kaynak Göster

APA
Çakır, B. (2012). Asmada (Vitis vinifera cv. Sultani Çekirdeksiz) Bax İnhibitor-1 Geninin İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu. Journal of Agriculture Faculty of Ege University, 49(3), 249-254. https://doi.org/10.20289/zfdergi.69696