Paraoksonaz-1 (PON1), paraoksonaz, arilesteraz ve laktonaz aktiviteleri gösteren, yüksek yoğunluklu lipoprotein (HDL) ile ilişkili bir enzimdir. Bu çok fonksiyonlu enzim, düşük yoğunluklu lipoprotein (LDL) oksidasyonunu önleyerek ve oksitlenmiş lipid seviyelerini azaltarak aterosklerozun önlenmesinde önemli bir rol oynamaktadır. Bu çalışma, çeşitli lipid düşürücü ilaçların PON1 ve polimorfik yapılarına [(M/L)55 ve (Q/R)192] olan afinitelerini gelişmiş moleküler doking yöntemleri kullanarak araştırmayı amaçlamıştır. Araştırma, PON1 ile çeşitli lipid düşürücü ajanlar arasındaki etkileşimleri analiz etmek için homoloji modellemesi, moleküler dinamik simülasyonu ve AutoDock 4 yazılımını içeren kapsamlı bir hesaplamalı yaklaşım kullanmıştır. Bu ajanlar arasında statinler (simvastatin, atorvastatin, lovastatin, mevastatin, fluvastatin, rosuvastatin, pravastatin), fibratlar (fenofibrat, gemfibrozil, bezafibrat, siprofibrat), niasin, ezetimib, orlistat, sibutramin, probukol ve fitosteroller (brasikasterol, kampesterol, β-sitosterol, stigmasterol) yeralmaktadır. Çalışma, builaçların PON1 ve polimorfik yapılarına değişen afiniteler gösterdiğini ortaya koymuştur. Özellikle, brasikasterol normal PON1 yapısına en yüksek afiniteyi gösterirken, sibutramin ve stigmasterol sırasıyla Q/R 192 ve M/L 55 polimorfik yapılarına en yüksek afiniteleri göstermiştir. Buna karşılık, orlistat hem normal PON1 hem de M/L 55 polimorfik yapısına en düşük afiniteyi gösterirken, atorvastatin Q/R 192 polimorfik yapısına en düşük afiniteyi göstermiştir. Bu bulgular, lipid düşürücü ilaçlar ile PON1 arasındaki potansiyel etkileşimler hakkında değerli bilgiler sağlamakta ve PON1 afinitesinin, özellikle farklı PON1 polimorfizmleri olan bireylerde lipid düşürücü tedavilerin seçiminde önemli olabileceğini göstermektedir. Bununla birlikte, bu hesaplamalı sonuçları doğrulamak ve klinik önemini belirlemek için daha fazla in vitro ve in vivo çalışma gereklidir.
Kardiyovasküler hastalık Lipid düşürücü ilaçlar Moleküler doking Paraoksonaz-1 (PON1) PON1 polimorfizmleri
Paraoxonase-1 (PON1) is a high-density lipoprotein (HDL)-associated enzyme that exhibits paraoxonase, arylesterase, and lactonase activities. This multifunctional enzyme plays a crucial role in preventing atherosclerosis by inhibiting low-density lipoprotein (LDL) oxidation and reducing oxidized lipid levels. The present study aimed to investigate the affinities of various lipid-lowering drugs to PON1 and its polymorphic structures [(M/L)55 and (Q/R)192] using advanced molecular docking methods. The research utilized a comprehensive computational approach, including homology modeling, molecular dynamics simulation, and AutoDock 4 software to analyze the interactions between PON1 and several classes of lipid-lowering agents. These included statins (simvastatin, atorvastatin, lovastatin, mevastatin, fluvastatin, rosuvastatin, pravastatin), fibrates (fenofibrate, gemfibrozil, bezafibrate, ciprofibrate), niacin, ezetimibe, orlistat, sibutramine, probucol, and phytosterols (brassicasterol, campesterol, β-sitosterol, stigmasterol). The study revealed varying affinities of these drugs to PON1 and its polymorphic structures. Notably, brassicasterol showed the highest affinity for the normal PON1 structure, while sibutramine and stigmasterol demonstrated the highest affinities for the Q/R 192 and M/L 55 polymorphic structures, respectively. Conversely, orlistat exhibited the lowest affinity for both normal PON1 and the M/L 55 polymorphic structure, while atorvastatin showed the lowest affinity for the Q/R 192 polymorphic structure. These findings provide valuable insights into the potential interactions between lipid-lowering drugs and PON1, suggesting that consideration of PON1 affinity might be important in the selection of lipid-lowering therapies, particularly in individuals with different PON1 polymorphisms. However, further in vitro and in vivo studies are necessary to validate these computational results and establish their clinical relevance.
Cardiovascular disease Lipid-lowering drugs Molecular docking Paraoxonase-1 (PON1) PON1 polymorphisms
Ethical approval was not required for this study.
The numerical calculations reported in this paper were partially performed at TUBITAK ULAKBIM, High Performance and Grid Computing Center (TRUBA resources).
Birincil Dil | İngilizce |
---|---|
Konular | Farmasotik Biyoteknoloji, Tıbbi biyokimya - Proteinler, Peptitler ve Proteomik |
Bölüm | Araştırma Makaleleri |
Yazarlar | |
Erken Görünüm Tarihi | 24 Aralık 2024 |
Yayımlanma Tarihi | |
Gönderilme Tarihi | 6 Kasım 2024 |
Kabul Tarihi | 19 Aralık 2024 |
Yayımlandığı Sayı | Yıl 2024 Cilt: 3 Sayı: 4 |
*Dergiye gönderilecek yazılar aşağıda verilen örnek dosyalara göre hazırlanmalıdır. Dergi formatına uygun hazırlanmayan yazılar Yazar(lar)a iade edilecektir.
1. ÖZGÜN MAKALE ŞABLONU/ORIJINAL ARTICLE TEMPLATE
2. OLGU SUNUMU ŞABLONU/CASE REPORT TEMPLATE
3. DERLEME ŞABLONU/REVİEW TEMPLATE
5. TELİF HAKKI TRANSFER FORMU/COPYRİGHT TRANSFER FORM
**Uluslararası Tıp Dergileri Editörler Kurulu (ICMJE) yönergesi