Diagnostic Methods of Shiga Toxigenic Escherichia coli
Öz
Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) is an important zoonotic pathogen associated with clinically significant conditions such as hemorrhagic colitis and hemolytic uremic syndrome (HUS), which are of considerable public health importance. Accurate diagnosis is critical for outbreak control. This study focuses on the main methods used for the laboratory diagnosis of STEC.
Traditional diagnostic methods, particularly the evaluation of the sorbitol reaction on sorbitol-MacConkey agar and selective chromogenic media, form the basis of traditional STEC diagnosis. However, the prevalence of non-O157 serotypes has led to the inadequacy of methods based solely on phenotypic characteristics. Therefore, molecular methods used to detect Shiga toxin genes (stx1, stx2) and other virulence genes (eae, ehxA) have come to the fore. Real-time PCR (qPCR) and multiplex PCR techniques provide faster results with high sensitivity. The combined use of culture and molecular methods enables reliable and rapid diagnosis of STEC infections.
Anahtar Kelimeler
Culture, Diagnosis, Molecular methods, STEC, Public health
Shiga Toksijenik Escherichia coli’lerin Teşhis Yöntemleri
Öz
Shiga toksijenik Escherichia coli (STEC), hemorajik kolitis ve hemolitik üremik sendrom (HÜS) gibi halk sağlığı açısından oldukça önemli klinik tablolarla ilişkili önemli bir zoonotik patojendir. Doğru teşhis, salgın kontrolü açısından kritik öneme sahiptir. Bu çalışmada STEC’in laboratuvar tanısında kullanılan başlıca yöntemler üzerine odaklanılmıştır.
STEC’in teşhisinde geleneksel teşhis yöntemlerinden, özellikle sorbitol-MacConkey agarda sorbitol reaksiyonun değerlendirilmesi ve selektif kromojenik besiyerleri, geleneksel teşhisin temelini oluşturur. Ancak non-O157 serotiplerin yaygınlığı sadece fenotipik özelliklere dayalı yöntemlerin yetersiz kalmasına yol açmıştır. Bu nedenle Shiga toksin genleri (stx1, stx2) ile diğer virülans genlerinin (eae, ehxA) saptanmasında kullanılan moleküler yöntemler ön plana çıkmıştır. Gerçek zamanlı PCR (qPCR) ve multipleks PCR teknikleri, yüksek sensitivite ile daha hızlı sonuç vermektedir. Kültür ve moleküler yöntemlerinin birlikte kullanımı, STEC enfeksiyonlarının güvenilir ve hızlı teşhisini mümkün kılmaktadır.
Anahtar Kelimeler
Halk sağlığı, Moleküler yöntemler, Kültür, STEC, Teşhis
Yazarlar bu derleme makalede, yalnızca daha önce yayımlanmış ilgili literatür çalışmalarına dayanıldığını bu nedenle de etik onay gerekmediğini beyan etmişlerdir.