Karadeniz Fen Bilimleri Dergisine gönderilen makaleler, ithenticate vb. gibi uluslararası geçerliliği olan intihal tespit programları kullanılarak benzerlik kontrollerine tabi tutulur. Benzerlik oranının belirlenmesinde benimsenen kurallar aşağıdaki gibidir:

(a) Makalenin genel benzerlik oranı %25 veya daha az olmalıdır. Bu aşamada genel benzerlik oranı %25'in üzerinde olan makaleler hakemlik sürecine girmeden yazarına iade edilir.
(b) Belirli bir kaynağa benzerlik oranı, makalenin genel benzerlik oranında %3'ten az olmalıdır.
(c) Bibliyografik materyaller (bibliyografya, alıntılar vb.) taramaya dahil edilmez.
(d) Editörler, hakemlik süreci sırasında ve sonrasında benzerliği yayın sürecinin her zamanında kontrol edebilirler.
(e) Yukarıda belirtilen kuralların makale başvurusunda bulunan tüm yazarlar tarafından kabul edildiği varsayılır.

Dergi, intihal içerdiği tespit edilen yayınlanmış makaleler için aşağıdaki ciddi önlemleri alacaktır:
• Dergi, yazar(lar)ın bağlı bulunduğu üniversite ile ilgili yazar hakkında son işlem yapmak üzere derhal iletişime geçecektir.
• Dergi, yayınlanan makalenin PDF kopyasını web sitesinden kaldıracak, yayınlanan makaleyi sayı dosyasından kaldıracak ve yayınlanan makaleye verilen tüm bağlantıları devre dışı bırakacaktır. Yayınlanan makalenin başlığına "İntihal Makale" ibaresi eklenecektir.
• Dergi, yazarın hesabını devre dışı bırakacak ve sonraki 2 yıl boyunca yazarın gelecekteki tüm gönderilerini reddedecektir.