Dr. Ayhan Bekleyen, daha çok yapılı çevre değerlendirmelerine yönelik çalışmalar yapmaktadır. Mimari tasarım, bina tasarım ilkeleri, çağdaş ve geleneksel konut tasarımı, yapılı çevre değerlendirmesi ve arkitektonik yüzey tasarımında yeni yaklaşımlarla ilgili çeşitli dersler vermektedir. Ayrıca Orta Doğu mimarisinin kültürel ve iklimsel bağlamlarına odaklanan çeşitli sunumları da bulunmaktadır. Türkiye’nin güneydoğusunun ayrıcalıklı yapılı çevrelerinin çeşitli görünüşlerine vurgu yapan yayınları, geçmişe ait sürdürülebilir bina özelliklerinin gelecek bina tasarımlarına uyarlanması üzerine de odaklanmaktadır. Makaleleri; Journal of Architecture, Journal of Housing and the Built Environment, Habitat International, Frontiers of Architectural Research, Journal of Building Engineering ve Urbani Izziv/Urban Challenge gibi tanınmış uluslararası bilimsel dergilerde yayınlanmıştır.