İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi’nden 1999 yılında mezun oldu. Aynı yıl TUS sınavı sonrasında Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Farmakoloji Anabilim Dalında uzmanlık eğitimine başladı. 2003 yılında uzman ve ardından yardımcı doçent oldu. Haziran 2007 yılında doçentliğe ve Şubat 2013’te profesörlüğe yükseltildi.
2008 yılında beyin nörotransmitter ölçümü yapabilen Türkiye’deki ilk, Avrupa’daki 2. “Beyin Sensör Laboratuarı”nı Atatürk Üniversitesi Tıbbi Farmakoloji Anabilim Dalı’nda kurdu. Çok sayıda TÜBİTAK projesinde (1001/1003) yürütücülük yaptı. Bu projeler sonucunda nörotransmitter kaydı yapabilen “biyouyumlu ilk beyin elektrotları”nı ekibiyle birlikte üretti. Ayrıca yine ekibiyle birlikte beyin hastalıklarının teşhis ve tedavisinde kullanılacak dünyadaki ilk “beyin nörotransmitter düzeyi ölçebilen tıbbi cihaz”ını üretti. Elektrot ve cihazların ulusal ve uluslararası patent başvurularını yaptı.
Uluslararası SCI ve SCI-E kapsamındaki dergilerde 140 makalesi bulunmaktadır. Hacımüftüoğlu’nun editörlüğünü yaptığı kitabı yayınlanmıştır. Nature (Springer) Lipids in Health and Disease dergisinde editör olarak görev yapmaktadır. Hacımüftüoğlu’nun, Google Scholar kayıtlarına göre son 1 yılda makalelerine 660 atıf yapılmıştır.
9 yüksek lisans, 14 doktora öğrencisi mezun etmiştir.
Hacımüftüoğlu, Türkiye’nin ilk ilaç adayı orijinal ürün ilaç patentlerini 2019, 2020 ve 2021 yıllarında Amerika, Japonya, Avrupa Birliği ve Kanada’dan almıştır. Bu ürün, Sağlık Bakanlığı ve Türk Patent Enstitüsüne göre etken maddesi ülkemizde keşfedilmiş ve patentleri alınmış ilk üründür. Hacımüftüoğlu’nun 5’i uluslararası olmak üzere toplam 15 patenti bulunmaktadır.
Ahmet Hacımüftüoğlu, Avrupa Sinir Bilim Federasyonu’nun (FENS) 2016’dan beri yönetim konseyi üyesi ve Türkiye temsilcisidir. 2019 FENS Sırbistan Kongresi’ni düzenleme görevini üstlenmiştir.
Hacımüftüoğlu, 2021 yılında Atatürk Üniversitesi Aşı Geliştirme ve Uygulama Merkezi Müdürlüğüne atanmıştır. Ülkemizin preklinik çalışmalardan başarıyla geçen aşılarından biri olan Atavaks aşısını ekibiyle birlikte üretmiştir. Aşı klinik çalışmalara girişi beklemektedir. Şu an Alzheimer Hastalığına yönelik aşı projesi ve çalışmalarını sürdürmektedir.

Aldığı Ödüller:
1. ISIF 2019 Altın Madalya, Bilim Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı, 2019.
2. Birleşmiş Milletlere Bağlı Avrupa Fikri Mülkiyet Ödülü (Wipo Best Akademic, Wipo Ompi), 2019.
3. En iyi Doktora Tezi Hocası Ödülü, Atatürk Üniversitesi, 2014.
4. Atatürk Üniversitesi Sağlık Bilimleri Patent Dalında Birincilik Ödülleri (2011-2012-2013 yılları).
5. Atatürk Üniversitesi Sağlık Bilimleri Etkin Makale Dalında Birincilik Ödülü (2011).
6. Atatürk Üniversitesi Bilimsel Teşvik Ödülleri. İki dalda birincilik, bir dalda ikincilik (2019).
7. Tıp Fakültesi En Yüksek Akademik Puanı, 2019

8. Tıp Fakültesi En Yüksek Akademik Puanı, 2020

9. Tıp Fakültesi En Yüksek Akademik Puanı, 2021